В 1548 году князь Николай Черный женился на представительнице польского аристократического рода Эльжбете Шидловецкой. В том же году умер Сигизмунд Старый. Польским королем и великим князем Литовским стал Сигизмунд Август. Князь Николай Черный уже давно входил в самое близкое окружение молодого короля. В 1550 году воевода виленский и великий маршалок земский Николай Радзивилл стал великим канцлером Литовским.
После отравления королевой-матерью Боной Сфорца Барбары Радзивилл, король Сигизмунд Август женился на дочери наследника императора Священной Римской империи Фердинанда Екатерине – именно Николай Черный готовил союзный договор короля и будущего императора. Он много времени уделял проблемам внешней политики Великого княжества Литовского.
В 1557 году Николай Черный возглавил государственную комиссию по проведению аграрной реформы в государственных имениях, которая подготовила «Устав на волоки». Новый порядок землепользования стимулировал развитие сельского хозяйства, он даже предусматривал решение экологических проблем.
В 1557 году князь Николай занялся присоединением к Великому княжеству Литовскому Инфлянтов – прибалтийских земель. В сентябре этого года Ливонский магистр В.Фюрстенберг подписал договор с канцлером Великого княжества Литовского, касающийся совместной обороны своих земель от Московского царства.
В начале 1558 года царь Иван IV начал Ливонскую войну. Московский царь предложил Великому княжеству Литовскому заключить союз, направленный против крымского ханства. Николай Черный отказался от союза, полагая, что Иван IV хочет оттянуть внимание Великого княжества Литовского от войны в Прибалтике. В августе 1559 года в Вильне был подписан договор о государственном союзе и протекторате Великого княжества Литовского над Инфлянтами. Войска княжества вошли на юго-восточные прибалтийские земли. В сентябре 1561 года ливонский орден распался. 28 ноября в Вильне был подписан акт о подчинении Инфлянтов Великому княжеству Литовскому и Короне Польской. Последний магистр Ливонского ордена стал герцогом Курляндским и вассалом короля Речи Посполитой Сигизмунда Августа.
Николай Радзивилл Черный стал администратором Инфлянтов и наместником короля в Великом княжестве Литовском.
В 1564 году князь Николай провел судебно-административную реформу в Княжестве. Бельский привилей установил создание сословных шляхетских судов и их отделение от великокняжеской администрации.
Поветовая реформа привела к созданию поветовых сеймиков – органов местного управления. Князь Николай Радзивилл участвовал и в подготовке Второго Статута Литовского, принятого в 1566 году.
