Восточный отдел — начальник 3-го (Дальний Восток) отделения (в 1922 г.) Михаил Маркович Казас (караим), заместителем начальника отделения был будущий известный советский разведчик Наум Исаакович Эйтингон;
Оперативный отдел — К.В. Паукер (с мая 1923 г., с февраля 1922 г. — заместитель начальника), помощник начальника Моисей Мордухович Алиевский (заместитель начальника в 1924–1925, затем вновь помощник начальника);
Информационный отдел — отделения госинформации и секретной информации по совместительству возглавлял Д.А. Рабинович;
В объединенном с ноября 1925 г. Отделе информации и политконтроля (ИНФО-ПК) 2 из 5 отделений руководили Борис Евсеевич Найман и А. г. Лундин.
Особое бюро по делам административной высылки антисоветских элементов интеллигенции (существовало в 1922–1923 г.г.) — начальник бюро Я.С. Агранов, помощник (один из трех) В.И. Хаскин;
В Экономическом управлении — начальник управления Зиновий Борисович Кацнельсон (с сентября 1922 по апрель 1925 г.), заместитель М.А. Дейч (1922–1923, перешел на хозяйственную работу), в 1922–1923 г.г. — 2 (из 6) начальников отделов (Л.А. Островский — отдел концессий и акционерных обществ,М.В.Бренер — отдел информации), в 1923–1924 г.г. — начальники 3 (из 8) отделений (Иосиф Маркович Островский — 2-е, легкая промышленность, 5-е-финансы — Борис Григорьевич Голышев, 6-е — транспорт и связь — Николай Давидович Шаров), в 19 241 925 г.г. начальники 4 (из 8) отделений (1-е — тяжелой и топливной промышленности — Арон Львович Молочников, И. М. Островский — 2-е,5-е — внешняя торговля — Лев Григорьевич Миронов, 6-е — финансы — Соломон Меерович Когенман, затем Лев Лазаревич Никольский);
Административно-организационное управление — начальник административного отдела Абрам Петрович Флексер, начальник санитарной части М. г. Кушнер, начальник ФИНО Л. И. Берензон;
Главный инспектор войск и начальник Отдела пограничной охраны ОГПУ (с декабря 1925 г.) — З.Б. Кацнельсон (по совместительству начальник Высшей пограничной школы ОГПУ);
В территориальных органах ГПУ-ОГПУ в последний период руководства Дзержинского (1922–1926) на руководящей работе находились: в полпредстве в Ленинградском военном округе — полпред Мессинг, из начальников, входивших в-ПП губернских отделов, — Абрам Иосифович Мильнер (Новгород, 1922–1924, за «колебания» по отношению к внутрипартийной оппозиции по предложению Дзержинского переведен на пост председателя губернского Совета народного хозяйства, т. е. в систему руководимого Феликсом Эдмундовичем ВСНХ) и Борис Михайлович Гордон (Архангельск, с января 1925 г.); в Московском военном округе — начальник Вятского ГО Залман Куслевич Аргов (с октября 1924 г.);
