9 июня 1938 г. приказом НКВД СССР № 00362 была объявлена новая структура оперативно-чекистских управлений НКВД СССР:
Управление государственной безопасности (1 управление) — (начальник — первый заместитель наркома ВД СССР, комкор М.П.Фриновский);
Управление особых отделов (УОО или 2 управление) — (комбриг Н.Н.Федоров);
Управление транспорта и связи (3 управление) — (комиссар гб 3 ранга Б.Д.Берман);
Структура 1 управления была следующей:
1 отдел (охрана правительства) — (комиссар гб 3 ранга И.Я.Дагин);
2 отдел (оперативный отдел) — (старший майор гб И.П.Попашенко);
3 отдел (КРО) — (комиссар гб 3 ранга Н.Г.Николаев-Журид);
4 отдел (СПО) — (майор гб А.С.Журбенко);
5 отдел (ИНО) — (старший майор гб 3.И.Пассов);
6 отдел (наблюдение за милицией, пожарной охраной, военкоматами) — (майор гб И.Д.Морозов);
7 отдел (оборонной промышленности) — (майор гб Л.И.Рейхман);
8 отдел (промышленный) — (комиссар гб 3 ранга А.М.Минаев-Цикановский);
9 отдел (сельского хозяйства) — (должность начальника отдела торговли, заготовок была вакантной).
Этим же приказом НКВД СССР в составе центрального аппарата НКВД СССР были организованы следующие самостоятельные оперативно-чекистские отделы:
Учетно-регистрационный отдел (УРО) (1 спецотдел НКВД СССР) — (старший майор гб И.И.Шапиро);
Отдел опертехники (2 спецотдел) — (врио начальника — майор гб М.С.Алехин);
Спецотдел (шифровальный) — (капитан гб А.Д.Баламутов);
Тюремный отдел — (майор гб Н.И.Антонов-Грицюк).
На основании постановления ПВС СССР от 16 апреля 1938 г., объявленного приказом НКВД СССР № 370 от 11 июня 1938 г. Центральное архивное управление из ведения бывшего ЦИК СССР было передано в ведение НКВД СССР.
На основании постановления СНК СССР от 17 апреля 1938 г. акционерное общество "Интурист" было передано в ведение НКВД СССР. Приказом НКВД СССР № 478с от 9 августа 1938 г. а/о "Интурист" было подчинено АХУ НКВД СССР, а в циркуляре НКВД СССР № 165сс от 16 августа 1938 г. было записано: "О переходе местных отделений и представительств "Интурист" в ведение НКВД должны знать только заведующие местными отделениями "Интурист". Местные отделения "Интурист" в дальнейшем сохраняют свое прежнее название и вопрос о переходе "Интуриста" в ведение НКВД разглашению не подлежит".
Но вхождение "Интуриста" в НКВД было недолгим. В структуре НКВД СССР, объявленной приказом НКВД СССР № 00641 от 29 сентября 1938 г., "Интурист" уже не значился.
