Хотя работы по переоборудованию в авианосец начались еще летом, только в самом конце года они набрали темп. Согласно воспоминаниям Мацумото, работы на авианосце велись очень энергично. Несмотря на все старания сохранить в секрете новое назначение корабля, рабочие верфи проявили необычайный интерес к переоборудованию. Для них возрожденный «Синано» стал символом и надеждой.
Переоборудовать линкор типа «Ямато» в авианосец оказалось почти так же трудно, как и построить новый корабль. От киля и до главной палубы «Синано» повторял «Ямато», то есть имел двойное и тройное днище, бронированные були ниже ватерлинии, хорошо забронированные артиллерийские погреба, рулевые отсеки, машинные отделения и топливные цистерны. Поверх всего этого предполагалось построить авианосный верх — бронированную полетную палубу, остров, ангар, авиаремонтные мастерские, хранилища боеприпасов. Предстояла просто колоссальная работа.
Главной характерной чертой «Синано» стала очень мощная броневая защита. По ватерлинии авианосец прикрывал главный пояс толщиной 8 дюймов, что было вдвое меньше, чем на «Ямато» и «Мусаси». Тройное днище в районе машинных отделений давало дополнительную защиту от мин.
Самой заметной из переделок стало переоборудование артиллерийских погребов «Синано». Барбеты и погреба, прикрытые 7-дюймовой броней, были приспособлены для работы с авиационными боеприпасами. Были установлены скоростные бронированные элеваторы для подъема бомб, торпед и зенитных снарядов прямо на полетную палубу — так были учтены уроки Мидуэя.
Вы главной палубы все выглядело, как на настоящих авианосцах. После того, как была положена 100-мм бронированная полетная палуба, начались работы в ангаре. По пересмотренному проекту предусматривался только один уровень ангара. С учетом требований остойчивости и общего веса, а также потому, что уже была установлена главная броневая палуба, от двух уровней ангара, как на «Тайхо» и «Дзуйкаку», пришлось отказаться. Поэтому корабль имел небольшую авиагруппу для своих размеров.
На «Синано» ангар делился на две части вертикально броневой переборкой, а сверху имелась полудюймовая противоосколочная подложка. В носовой части ангара предполагалось держать 18 истребителей «Реппу» — модернизированная модель «Зеро». Кормовая часть была достаточно вместительной, чтобы принять 18 ударных самолетов «Рюсэй». Авиагруппы завершали 6 разведчиков «Сайюн».
Итоги битвы при Мидуэе сказались на конструкции ангарной палубы. Закрытые ангары авианосцев превращали пожары в настоящее бедствие. Кроме того, в случае пожара в ангаре оказалось невозможно сбросить на борт боеприпасы. На «Синано» эту опасность постарались уменьшить насколько возможно, сделав первые две трети ангара открытыми с бортов, на случай плохой погоды и ночных операций их прикрывали подвижные стальные экраны. Задняя треть ангара была полностью закрытой, ее защищала 2-дюймовая броня.
