23 марта 1938 года Глушко был арестован и в августе 1939 года приговорен к восьми годам лагерей. После вынесения приговора он работал на Тушинском авиазаводе №82. В 1940 году вместе с группой авиаконструкторов переведен в Казань на авиационный моторостроительный завод № 16, где создано КБ спецотдела НКВД, позднее переименованное в ОКБ-СД (Опытное конструкторское бюро специальных двигателей). Под руководством Глушко, главного конструктора этого КБ, были созданы вспомогательные самолетные ЖРД РД-1, РД-1ХЗ, РД-2, работавшие на азотной кислоте и керосине. Двигатели прошли испытания на самолетах различных типов. РД-1 был принят к серийному производству в 1945 году.
27 июля 1944 года Глушко был досрочно освобожден из заключения со снятием судимости и в августе 1945 года за создание двигателя РД-1 награжден орденом Трудового Красного Знамени. С июля по декабрь 1945 года и с мая по декабрь 1946 год он, в составе группы советских специалистов, выезжал в Германию, где изучал конструкцию двигателя баллистической ракеты ФАУ-2 и другой ракетной техники.
В июле 1946 года, после возвращения в Москву, Глушко был назначен главным конструктором ОКБ-456 Минавиапрома, образованного в подмосковных Химках на базе Государственного союзного завода № 456. Длительное время в открытой печати эта организация носила название ГДП-ОКБ. К концу 1946 года в Химки из Казани был переведен весь конструкторский коллектив Глушко.
Московский завод № 84 имени В.П.Чкалова для ремонта самолетов Гражданского воздушного флота был построен в Химках в 1932 году. Позже здесь под руководством главного конструктора Владимира Мясищева была освоена сборка лицензионного самолета "Дуглас" ДС-3, получившего отечественный индекс ЛИ-2. 30 октября 1941 года завод эвакуирован в Ташкент. На его производственных площадях остались авиаремонтные мастерские для восстановления фронтовых самолетов. 16 апреля 1942 года на базе мастерских создан Государственный союзный завод № 456. 19 января 1946 года завод становится филиалом опытного производства ОКБ авиаконструктора Сергея Ильюшина. Приказом министра авиационной промышленности от 3 июля 1946 года, изданного на основании постановления Совета Министров СССР от 13 мая 1946 года, завод был перепрофилирован на выпуск ракетных двигателей и стал производственной базой ОКБ-456 и его Опытного завода этого ОКБ.
Вот выписка из приказа министра авиационной промышленности Михаила Хруничева:
