После некоторой приостановки деятельности в конце правления Сталина и в ходе последующих политических перестановок работы по подземному заводу, получившему номер 139, возобновились.
Но с массовым внедрением ядерного оружия сама идея такого высокозащищенного предприятия теряла смысл. Даже в том случае, если подземные цеха и остались бы невредимыми, колоссальные разрушения и высокий уровень радиоактивного заражения у выходов из штолен исключали вывоз с завода готовой продукции. Да и применять ее было бы уже некому и не по чему…
В конечном счете, на месте строившегося завода №139 обосновалось СКБ-375 – ведущая организация по проектированию баллистических ракет подводных лодок, возглавляемая В.П. Макеевым.
Постановлением от 27 ноября 1951 г. ракету Р-2 приняли на вооружение и запустили в серийное производство как в Подлипках, так и в Днепропетровске. В мае-июне 1954 г. провели испытания 10 ракет, изготовленных по документации для серийного производства, восемь из которых отлетали успешно.
Помимо ставших традиционными пусков на максимальную дальность, были проведены и испытания ракеты Р-2 на промежуточные дальности 200 и 270 км. При этом выявилась пониженная точность попаданий. Было признано целесообразным при пусках на эти дальности применить одну либо две дополнительные головные части.
В начале 1950-х гг., когда количество изготовленных в СССР атомных бомб исчислялось всего несколькими десятками, большое внимание уделялось возможности использования в качестве средства поражения радиоактивных веществ. Начиная с 1953 г. проводилась разработка ракет с головными частями «специального наполнения» в жидкостном и снарядном снаряжении. Однако при простоте и низкой стоимости эти головные части были крайне опасны в эксплуатации и не допускали возможности длительного хранения. По мере количественного наращивания арсенала классического атомного оружия данное боевое оснащение дальнейшего развития не получило.
Имеется информация о том, что в начале 1950-х гг. проводились проектные оценки применения ядерных зарядов на Р-2, но практически атомное оружие нашло применение на следующей ракете ОКБ СП. Королева с вдвое большей дальностью – Р-5М.
Как и ракета Р-1, доработанная Р-2 задействовалась для исследований верхних слоев атмосферы с оснащением спасаемым контейнером, содержащим 260 кг научной аппаратуры. С 1957 по 1960 г. провели 13 пусков модификации Р-2А на высоты до 208 км, 11 из которых закончились успешно. Контейнеры с научной аппаратурой в дальнейшем стали первыми «космическими» экспонатами Выставки достижений народного хозяйства (ВДНХ) СССР.
