Колледж Шарце включает одиннадцать отделений: Докханг (rDo-khang Khang-tshan), Пхукханг (Phu-khang Khang-tshan), Ньяг Ре (Nyag-re Khang-tshan), Лхопа (Lho-pa Khang-tshan), Зунгчу (Zung-chu Khang-tshan), Тхепо (The-po Khang-tshan), Чони (Co-ni Khang-tshan), Та Он (rTa-'on Khang-tshan, rTa-dbon Khang-tshan), Нгари (mNga'-ris Khang-tshan), Согпа (Sog-pa Khang-tshan) и Гунгру (Gung-ru Khang-tshan) кхангцены.
Образовательные программы обоих колледжей Гандена – Джангце и Шарце – сочетают изучение и сутры, и тантры. В этом они отличаются от двух других главных гелугпинских монастырей в районе Лхасы – Сера (Se-ra dGon-pa) и Дрепунга. Из четырёх колледжей Дрепунга в колледжах Лосел Линг (Blo-gsal gling Grva-tshang) и Гоманг (sGo-mang Grva-tshang) изучают только сутру, в колледже Нгагпа (sNgags-pa Grva-tshang) – только тантру, а в колледже Деянг (bDe-dbyangs Grva-tshang) – и то, и другое. Из трёх колледжей Сера в колледжах Дже (Byes Grva-tshang) и Ме (sMad Gvra-tshang) изучают только сутру, а в колледже Нгагпа (sNgags-pa Grva-tshang) – только тантру. В Индии колледжи Дрепунг Нгагпа и Сера Нгагпа добавили в свои программы изучение сутры. Колледж Дрепунг Деянг не был восстановлен.
Колледж Джангце, так же как колледжи Сера Дже и Сера Нгагпа, следует учебникам сутры (yig-cha) Джецунпы Чокьи Гьелцена (rJe-btsun-pa Chos-kyi rgyal-mtshan) (1469–1544). В колледже Шарце, так же как в Дрепунг Лосел Линге и в тантрическом колледже Дрепунг Нгагпа, используют учебники Пятнадцатого Ганден трипы Панчена Сонама Драгпы (Pan-chen bSod-nams grags-pa) (1478–1554). Что касается других колледжей трёх главных гелугпинских монастырей в районе Лхасы (gdan-sa gsum), то в колледже Сера Ме принят учебник сутры Кхедруба Тендарвы (mKhas-grub dGe-'dun bstan-pa dar-rgyas) (1493–1568), а колледжи Дрепунг Гоманг и Дрепунг Деянг используют учебники, написанные Первым Кункхьеном Джамьянгом Шепой Нгавангом Цондру (Kun-mkhyen 'Jam-dbyangs bzhad-pa Ngag-dbang brtson-'grus) (1648–1721). Все колледжи следуют текстам Цонкапы, Гьелцаба Дже и Кхедруба Дже, а их учебники отличаются лишь тонкостями толкования.
В обучение входит заучивание, логический анализ и дебаты. В течение трёх лет монахи изучают подготовительные предметы – логику. Основная часть обучения включает пять главных текстов и длится одиннадцать последующих лет. В конце каждого года монахи должны сдавать экзамены (rgyugs-sprod), чтобы перейти на следующий курс. Тот, кто по истечении этих одиннадцати лет завершил изучение сутры и прошёл через формальные дебаты перед смешанным собранием всех монахов колледжа (gling-bsre dam-bca'), получает степень геше-цогрампы (dGe-bshes Tshogs-ram-pa). Тот, кто продолжает обучение следующие пять лет, а потом во время большого молитвенного фестиваля в Лхасе, в храме Джокханг выдерживает формальные дебаты перед общим собранием монахов трёх главных гелугпинских монастырей, расположенных в районе Лхасы, получает звание геше-лхарампы (dGe-bshes Lha-ram-pa). Монахи, которые просто сдают экзамены по заучиванию главных текстов, но не завершают обучение на звание геше, получают степень кьеримпы (bsKyed-rim-pa).
