173-й отряд принимал активное участие в наведении порядка в Баку, в Республике Северная Осетия во время осетино-ингушского конфликта, а также в Нагорном Карабахе. В 1992 году 22-я обрСпН была переведена в Северо-Кавказский военный округ.
В 1992 году два отряда 16-й бригады Московского военного округа были направлены в Таджикистан для оказания помощи в поддержании конституционного порядка.
В 1988–1989 годах три отряда 12-й бригады специального назначения Закавказского военного округа принимали участие в наведении конституционного порядка в Закатальском районе Азербайджана и в Тбилиси.
В 1991 году — в Нагорном Карабахе и Северной Осетии. В связи с осложнившейся обстановкой на территории Закавказья командование частями и соединениями СпН приняло решение о выводе бригады и передаче ее Уральскому военному округу.
В 1991 году из Германии была выведена бригада СпН и передана Приволжскому ВО. 4-я обрСпН, сформированная в Риге в 1962 году и до осени 1992 года находившаяся в г. Вильянди — Эстония, 1 октября была расформирована.
Был выведен из г. Печоры и позднее расформирован учебный полк специального назначения, готовивший сержантов и специалистов для войск, а также школа прапорщиков, находившаяся на его территории.
В результате дележа Вооруженных сил СССР Украине была предана 10-я обрСпН, размещавшаяся в Крыму. В результате реорганизации бригада была преобразована в 1-й парашютно-десантный полк ВС Украины.
В настоящее время расформированы 9-я бригада Киевского военного округа, располагавшаяся в Кировограде, и 8-я бригада Прикарпатского военного округа, дислоцировавшаяся в Изяславле.
Вооруженным силам Белоруссии отошла 5-я бригада специального назначения. Вооруженным силам Узбекистана — 15-я бригада специального назначения, 459-я орСпН, а также учебный полк специального назначения, готовивший во время афганской войны личный состав для воюющих подразделений.
Очень трудно пришлось «Вымпелу» в 90-е годы. Перестал существовать могущественный аппарат КГБ, место которого заняли другие структуры.
Всего за один год хозяевами «Вымпела» побывали: Межреспубликанская служба безопасности, Агентство федеральной безопасности и Министерство безопасности.
Постепенно менялся и характер задач подразделения. Новой России было уже не до имперских амбиций, поэтому главной задачей стало обеспечение внутренней безопасности.
Вымпеловцы начали осваивать борьбу с терроризмом. И освоили быстро — первые же учения, прошедшие в 92–93 годах, окончились с блестящими результатами.
