Николаевский «инцидент» был использован Японией для установления прямого режима оккупации. В ночь на 5 апреля 1920 года японские войска разгромили русские органы местной власти и военные гарнизоны во Владивостоке, Никольск-Уссурийском, Хабаровске, Раздольном, Спасске и ряде других пунктов.
Факты разрушения русских таможенных постов японцами на государственной границе России и Манчжурии свидетельствуют об истинной подоплеке событий 5 апреля: попытки присоединения Японией Русского Дальнего Востока к сфере своего влияния на Азиатском континенте. Соответственно, во всех городах и населенных пунктах на правительственных и муниципальных зданиях вывешивался флаг Японии. В ходе этих событий японские войска захватили северную часть Сахалина.
С конца 1920 года по март 1921 года при посредничестве Франции велись переговоры с Японией о доставке во Владивосток эвакуированной из Крыма армии Врангеля. Токио дал свое согласие и обязался обеспечить ее материально — обмундированием, питанием и вооружением. При этом Японское правительство поставило условием, чтобы по свержению Советской власти вся Сибирь с Дальним Востоком, а также все иностранные концессии на Востоке России и контроль над КВЖД перешли во владение Японии. Франция обязалась выполнить это требование.
В мае 1921 года Япония перевооружает вооруженные части Семенова и лучшие части Колчака, ранее служившие под командованием генерала В.О. Каппеля, погибшего от обморожения в декабре 1919 близ Иркутска, и бросает их на уничтожение Дальне-Восточной Республики, последнего своего конкурента к власти на всем Востоке России.
Народно-Революционная Армия ДВР, контролируемая Москвой, не только разгромила семеновские и каппелевские части, но к сентябрю 1922 года изгнала японские войска из Приморья, которые сконцентрировались во Владивостоке.
В течение всего периода интервенции и оккупации Востока России ведущие державы Антанты предпринимали попытки выработать на международном уровне общие позиции по вопросам отношений с Москвой.
Николаевский «инцидент» приводился Японией на международных конференциях в Вашингтоне, Дайрене и Чаньчуне в качестве доказательной основы для ведения отношений с Россией с позиций права силы. Получив отпор на Вашингтонской конференции (июль 1921 г.) от англосаксонских держав по поводу равенства американского и японского флотов, Япония стала действовать более тонко, без предъявления прямых упреков Москве. Америка хотела рассматривать проблемы Азии и регионов Тихого океана в контексте разоружения, что не совпадало с интересами Токио.
