А в конце завершающего периода войны войска ПВО прикрывали и фронтовые группировки войск, и объекты фронтового тыла, коммуникации, мосты на реках Висла, Варта, Нейсе. Участвовали также в блокаде окруженных войск противника в районе Бреслау (4-й корпус ПВО и 3-й КПВО прикрывал войска 2-го Белорусского, 1-го Белорусского, 1-го Украинского фронтов).
Наращивание системы ПВО осуществлялось маневрированием сил и средств для прикрытия Киева, Минска, Таллина, Риги, Вильнюса, Кишинева, Львова, Одессы.
Для более эффективного управления войсками при выполнении поставленных задач ГКО принял постановление № 5508сс10 от 29.03.44 г. «О реформировании фронтов ПВО и их передислокации».
Согласно данному постановлению Западный фронт переформировался в Северный фронт ПВО со штабом в Москве (командующий генерал-полковник М. С. Громадин), а Восточный — в Южный фронт ПВО со штабом в Харькове (командующий генерал-лейтенант Г. С. Зашихин). Закавказская зона ПВО была преобразована в Закавказский фронт ПВО со штабом в Тбилиси (командующий генерал-лейтенант артиллерии П. Е. Гудыменко). В состав Северного фронта вошли Особая Московская армия ПВО и 10 корпусных и дивизионных районов ПВО, а также 1-я отдельная бригада ПВО и части Курского корпусного района ПВО.
В Южный фронт ПВО вошли Львовский, Киевский, Харьковский, Одесский, Донбасский и Сталинградский корпусные районы и пять дивизионных районов ПВО, а также части Курского корпусного района ПВО в пределах фронта.
Граница между Северным и Южным фронтами ПВО была установлена на линии Луцк — Нежин — Новгород — Северский — Севск — Елец — Мичуринск — Пугачев.
В результате оба управления фронтами ПВО стали более активными, а управление подчиненными войсками стало более оперативным.
В апреле 1944 года все дивизионные и корпусные районы ПВО были преобразованы в дивизии и корпуса ПВО с присвоением им определенных номеров, как и в других видах Вооруженных Сил, в то же время истребительные и зенитно-артиллерийские дивизии делились по родам войск ПВО.
Кроме того, в штаты фронтов и входившие в них штаты корпусов и дивизий ПВО вошли тыловые учреждения (склады, мастерские, госпитали, лазареты и т. д.). Словом, была создана самостоятельная система снабжения всеми видами довольствия.
Это мероприятие было полезным, так как соединения получили определенную самостоятельность и мобильность. Войска ПВО стали носить общепринятые организационные наименования (бригады, дивизии, корпуса) и имели структуры с определенным статусом и положением. Это упрощало отработку документов и их обращение.
