Развитие республики по демократическому пути встречало противодействие внутренних реакционных сил. С середины 1959 правительство Касема стало проводить политику балансирования между правыми и левыми силами, ограничивать и даже подавлять деятельность патриотических организаций. В сентябре 1961 оно развязало войну против курдского народа, которая усугубила экономические трудности и вызвала возмущение прогрессивной общественности. Результатом такой политики явилась полная изоляция режима Касема, создавшая благоприятные условия для государственного переворота 8 февраля 1963. В результате переворота ключевые позиции в правительстве оказались в руках экстремистских лидеров Баас, вставших на путь физического уничтожения коммунистов и демократов. С помощью «национальной гвардии» они развернули массовую кампанию кровавого террора, в результате которой тысячи патриотов были убиты, десятки тысяч оказались в тюрьмах и концентрационных лагерях. От рук палачей погибли генеральный секретарь ИКП Салям Адиль (ар-Рады) и многие др. руководящие деятели ИКП. В июне 1963 правительство возобновило военные действия против курдов.
Реакционная политика правительства, экономические и финансовые затруднения, вызванные войной с курдами и свёртыванием деловых отношений с СССР и др. социалистическими странами, привели к росту недовольства в стране и к расколу в руководстве Баас. В этой обстановке 18 ноября 1963 армейская группировка во главе с Абдель Салямом Арефом захватила власть, распустила «национальную гвардию» и отстранила от руководства государством наиболее скомпрометировавших себя лидеров Баас. Период 1964—68 характеризовался непрерывной борьбой за власть между различными политическими группировками, частыми сменами правительств.
И. участвовал в отражении агрессии Израиля против арабских стран в июне 1967 (см. Израильская агрессия против арабских стран 1967). Правительство И. решительно выступило против израильской агрессии; оно требует вывода израильских войск со всех оккупированных арабских территорий, считая, что ликвидировать последствия израильской агрессии можно лишь вооружённым путём.
В июле 1967 правительство Т. Яхьи (июль 1967 — июль 1968) амнистировало большую группу политических заключённых и ослабило цензуру. В то же время, заявляя о намерении выполнить соглашение правительства Баззаза (первое в истории республики И. гражданское правительство; находилось у власти в сентябре 1965 — августе 1966) с курдами от 29 июня 1966 о мирном урегулировании курдской проблемы, правительство Яхьи на деле саботировало это соглашение. Выборы в парламент откладывались. Правительство ввело новые налоги, которые почти целиком легли на плечи трудящихся. Следствием такой политики явился рост недовольства в стране: участились случаи антиправительственных выступлений, особенно весной и летом 1968. 17 июля 1968 партия Баас И. совместно с группой офицеров — членов подпольной организации «Движение арабских революционеров» совершила государственный революционный переворот, а 30 июля 1968 вся полнота власти перешла к руководству партии Баас и правительству во главе с генералом Ахмедом Хасаном аль-
