Позже, находясь на службе в Министерстве финансов в период с 1981 г. по 1982 г., Фитцуотер исполнял обязанности помощника секретаря по делам прессы
Во время покушения на президента Рональда Рейгана, пострадал его помощник Джеймс Брейди. После того как президент поправился и стал вести активную политическую и государственную деятельность, Марлину Фитцуотеру было сделано приглашение работать в составе администрации президента.
Начиная с 1983 года, Фитцуотер успешно работает в Белом Доме в качестве специального помощника президента Рональда Рейгана, совмещая свои обязанности с должностью заместителя пресс-секретаря по внутренним делам. Спустя несколько лет, в январе 1987 года, Р. Рейган сделал Фитцуотера исполняющим обязанности пресс-секретаря и обозначил эту должность как «помощник президента по связям с прессой». Впоследствии, Фитцуотер стал действующим пресс-секретарем президента. Сам Фитцуотер отмечал, что Р. Рейган очень артистично выступал с речами на публике, как подобает настоящему актеру, и прекрасно умел себя держать на различных пресс-конференциях.
Марлин Фитцуотер проработал с Р. Рейганом все восемь лет, когда тот дважды становился президентом (1981–1989 гг.).
В период, когда Джордж Буш в 1989 году следующим 41-м президентом США, М. Фитцуотер остался в своей прежней должности пресс-секретаря.
Целями работы пресс-секретаря Марлин Фитцуотера считает следующее: от имени президента и администрации объяснять решения и проблемы американскому народу. Двух президентов он характеризует следующим образом: президент Рейган прекрасно выступал с речами, хорошо участвовал в формальных пресс-конференциях. Президент Буш являлся мастером неформальных пресс-конференций и личностных отношений с прессой. Если Рейган дал за восемь лет лишь 47 пресс-конференций, то Буш только за два года дал 122 пресс-конференции. К числу наиболее сложных вопросов М. Фитцуотер относит «ежедневное объяснение нашей политики в Персидском заливе. Это требовало ежедневного анализа и понимания нашей ситуации в конфликте в течение периода в несколько месяцев. Ежедневные брифинги были основным элементом в строительстве публичной поддержки возрастающей включенности Соединенных Штатов в проведение резолюции ООН против Ирака». А будущим специалистам по ПР он дает следующий совет: «Не забывайте об основах. Мы находимся в середине технологического взрыва в смысле распространения информации, но основные принципы сбора информации остаются теми же. Не теряйте чувства честности, точности и чувствительности по мере того, как вы будете овладевать новыми технологиями».
