По мнению Жана Гиро, вехой возникновения инквизиции являются 1227-1229 гг., когда владения графа Тулузского перешли к французской короне и "устанавливалось сотрудничество церковной и светской властей для поиска и наказания еретиков".
Американский церковник Шэннон считает, что хотя у инквизиции "нет дня рождения", она ведет свое начало с 1231 г., когда на основе эдикта Григория IX, отлучавшего всех вероотступников от церкви, в Риме были назначены инквизиторы не только с правом расследования, но и суда над еретиками.
Этот разнобой в датировках, по-видимому, объясняется чрезвычайным обилием издававшихся на протяжении XII-XIII вв. всевозможных папских документов, направленных против еретиков и весьма схожих по своему содержанию.
Попытка дать всеобщую историю инквизиции, которая отражала бы все ее этапы и разветвления, была предпринята только одним исследователем, а именно - американцем Генри Чарлзом Ли (1825-1909), но и ему не удалось полностью осуществить свои замыслы: деятельность папской конгрегации инквизиции (священной канцелярии) не была им освещена. Возможно, у исследователя не хватило времени или он отказался от этой темы из-за отсутствия документации или по другим неизвестным нам причинам.
Отсутствие такого раздела в работах Ли и других историков, в частности Жана Гиро, пытавшихся охватить всю историю инквизиции, на наш взгляд, выгораживает папство от вины за преступления инквизиции, создавая ложное представление, что "св. престол" стоял в стороне от деятельности инквизиционных трибуналов, в то время как он являлся подлинным вдохновителем и организатором инквизиции во вселенском масштабе, меняя на протяжении столетий методы и формы ее деятельности и избирая в различные эпохи различные объекты для преследования. Ж. Гиро называет конгрегацию инквизиции и испанскую инквизицию, учрежденную в 1481 г., инквизициями "нового времени", в отличие от средневековой инквизиции XII-XV вв., исследованию которой посвящен его труд.
Другой не менее существенный недостаток, свойственный многим светским историкам инквизиции, заключается в том, что они рассматривают ее только как средневековый институт, защищавший интересы феодальной церкви и феодального строя в целом. Между тем история инквизиции заканчивается в XX в.
Буржуазная и церковная историография бессильны объяснить инквизицию, причины ее появления, различные формы ее деятельности, вскрыть причины ее долговечности. Антиклерикальные историки объявляют инквизицию следствием органической "порочности" католической церкви и свойственного только ей одной духа нетерпимости, игнорируя тот факт, что своих противников с не меньшим ожесточением преследовала протестантская, православная и другие христианские церкви, как и другие религии. Современные церковные защитники инквизиции, хотя и высказывают лицемерное сожаление о ее "крайностях", выдают ее за инструмент "божественного провидения", с помощью которого церковь якобы спасала общество от разложения, а в случае Испании способствовала будто бы ее национальному сплочению и единству.
