Данный опыт был преподнесён общественности как доказательство абиогенеза. Но если разобраться, то можно заметить критические нарушения. В опыте были использованы не те начальные химические компоненты, аммиак не мог быть в таких количествах на Земле, а наличие метана не удалось найти в древнем остаточном глиноземе. Также в опыте были использованы не те условия. В течение недели он постоянно пропускал заряд через среду неограниченным количеством раз, когда как в условиях древней Земли считается, что молнии и были часты, но не могли сплошным потоком воздействовать на поверхность каждый час. Использование электрической искры соединяла аминокислоты, но также и разрывала их. В реальных условиях аминокислота не смогла бы просуществовать длительного времени.
Результат опыта был неудовлетворительным. Ему удалось получить всего 4 вида аминокислот из 20-ти необходимых. Причём среда, в которой были получены эти аминокислоты, содержала большое количество формальдегидов и кислот, оное говорит нам о том, что по сути так называемый «первичный бульон» был обычным ядом. Но и полученные аминокислоты не смогли бы образовать белок из-за проблемы хиральности, т. е. аминокислоты имел разный поворот от воображаемой оси, что не позволяло им соединяться между собой, в произведённом «бульоне» содержались как правозакрученные, так и левозакрученные, которые и участвуют в образовании белка. Одной «правозакрученной» аминокислоты уже достаточно для того, чтобы образование более сложных структур стало невозможным. Ещё в опыте не был использован кислород, который мог на корню разрушить органические связи. Считается, что его не существовало на Земле, однако так и не было представлено объяснений нахождений геологами оксидированных камней в глубинных отложениях. При всей критики опыта Миллера стоит напомнить ещё и тот момент, что он как биохимик использовал только те газы, которые могли ему помочь в получении аминокислот, отбрасывая «мешающиеся» элементы. Т. е. он как Разум руководствовался своими знаниями для создания условий, когда как абиогенез предполагает невмешательство в природную среду.
Хуберт Йоки подсчитал, что вероятности способности спонтанного формирования протеина, состоящего хотя бы из 100 аминокислот меньше 1 из 10>65 степени шанса. Используя математический аппарат и знания биохимии, можно попробовать подсчитать вероятность зарождения жизни. Фред Хойл вместе с британскими исследователями с помощью суперкомпьютера подсчитал вероятность образования случайного происхождения протеина амёбы, состоящей из 2 тысяч протеинов. Полученный результат равнялся 1 шансу из 10 в 40.000-й степени. Этого достаточно, чтобы похоронить всю теорию самозарождения жизни эволюционистов.
