На крайней оконечности "магеллановой" области расположена природная зона тундры. Здесь растительность очень скудная, древесные виды представлены в основном Дримисом Винтера или канело (Drimys winteri), коигуэ или буком березовым (Nothofagus betuloides) и ньирре или буком антарктическим (Nothofagus antarctica), а южнее 49 градуса южной широты древесная растительность почти полностью отсутствует. Растения здесь представлены кустарниковыми и травянистыми видами, мхами и лишайниками.На островах - Пасхи и Хуан Фернандес - сформировалась уникальная флора благодаря их удаленности от материка. Например, только на острове Пасхи встречается дерево Торомиро (Sophora toromiro), которое в дикой природе больше нигде не встречается. На островах Хуан Фернадес обнаружены более 200 эндемичных видов растений, среди которых своей уникальностью выделяется Хуания (Juania australis) - дерево из семейства пальмовые.- это особые экосистемы, сформированные на высокогорье горного хребта, который проходит через всю страну с севера на юг. Растительность высокогорья меняется в зависимости от широты местности. Например, на севере Чили наиболее важными видами являются льярета из семейства бобовые (Azzorella сompacta) и злаковое растение Panicum prionitis, в Центральном Чили - кустарник Чукирага (Chuquiraga oppositifolia), фабиана (Fabiana imbricata) и эфедра андийская (Ephedra andina). В настоящее время в Чили отмечено 11 видов растений, которые находятся под угрозой исчезновения. Это такие растения как Авельянита (Avellanita bustillosii) - эндемический вид растений из семейства молочайные, распространенный в прибрежных горах регионов Метрополитана и О Хиггинс, растущее на дренированных почвах близи русла рек; бейлшмедия (Beilschmiedia berteroana) - эндемический древесный вид, распространенный от региона Метрополитана до региона Био-Био, растущий на различных высотах; берберидопсис (Berberidopsis Corallina), эндемичный вид, растущий от региона Мауле до региона Био-Био в сырых местах, связанных с небольшими водотоками; Berberis litoralis, эндемичный вид барбариса, растущий только в прибрежных районах вблизи Папосо (регион Антофагаста); Dalea Azurea из семейства бобовые, которое растет в южной части региона Антофагаста в области прибрежного тумана; кеуле (Gomortega keule), эндемичное дерево из семейства гомортеговые, растущей в прибрежной зоне регионов Мауле и Био-Био; Metarma lanosa, эндемичное растение семейства парнолистниковые, обитающее в предгорьях Анд в регионах Арика и Паринакота и Тарапака; Nothofagus alessandrii, эндемичный вид из семейства буковые с ограниченным распространением в провинциях Талька и Каукенес; Pitavia рипсilla (каньелито), эндемический древесный вид из семейства рутовые, которое произрастает в регионах Мауле и Араукания, исключительно в Береговой Кордильере; Myrcianthes coquimbensis, эндемичный вид семейства миртовые, который встречается только в регионе Кокимбо; Valdivia gayana, травянистое растение, растущее в поймах рек на юге Чили.
