Флора Чили разнообразна и имеет большое количество эндемических видов в связи с особыми географическими условиями - почти полной "закрытостью" страны от остального мира (Чили часто называют островом в Южной Америке), наличием различным типов климата и высокогорным положением большей части страны.
Растительность и флора во многом обусловлены топографией Анд (высотная поясность и наличие непрерывной полосы растительности засушливого климата, которая пересекает Южную Америку в направлении с северо-запада на юго-восток, начиная с побережья Эквадора, и которая изолирует область средиземноморских и умеренных лесов Чили и Аргентины от остальной части континента), а также ранним отделением территории Чили от остальной территории Гондваны - связь между этими частями суперконтинента исчезла в палеогене.
Территория Чили в целом входит в неотропическое царство, однако во флоре велика доля новозеландских и южно-австралийских видов из-за существовавшего сухопутного "моста" между этими территориями.
Флора Чили включает неотропические (28 %) и австрало-азийские (20 %) виды, которые были внедрены на территорию страны в различные геологические и исторические эпохи. Отмечается диспропорция в биологическом разнообразии, которое относительно невысоко (в Чили встречается около 3500 видов растений, для сравнения в Беларуси более 11000 растительных видов, хотя территория страны намного меньше) и высоким процентом эндемичных видов (в некоторых семействах - до 90 %). Высокая степень эндемичности приводит к высокой уязвимости растительности и указывает на древний возраст растительных сообществ.
Большое количество типов климата и рельеф сильно влияют на развитие экосистем и, следовательно, флору и растительность.
Северное Чили. На севере Чили формируются экосистемы ксероморфного типа. Географически простирается от северной границы страны до 30-31 градуса южной широты.
Эта зона характеризуется уникальной растительностью в связи с крайней засушливостью климата. Такие условия позволяют сформироваться здесь одной из самых сухих пустынь в мире - Атакаме. Древесные и кустарниковые растения, такие как тамаруго (Prosopis tamarugo), пимиенто (испанский перец), альгарробо (рожковое дерево, Ceratonia siliqua), чаньяраль (Geoffroea decorticans) и различные воды кактусов, например, Trichocereus atacamensis, - немногие растения, которые могут адаптироваться к крайе сухому климату. Только постоянные туманы каманчакас позволяют расти в горной части пустыни таким цветковым растениями, как льярета и кеньоа. Во время редких проливных дождей, обычно сентябрьских, пустыня начинает "цвести" и появляются красиво цветущие виды, такие как родофиала (Rhodophiala rhodolirion), каландрия двухцветная (Calandrinia discolor) и кристария андийская (Cristaria Glaucophylla). Наиболее сильные и длительные туманы наблюдаются на высоте 500-700 метров над уровнем моря. В наиболее сухих местах растительность либо отсутствует (по крайней мере, в период, когда не выпадают ливни), либо присуствует только по руслам временных водотоков.
