Труднее было отстоять равноправие кальвинистов, которые после Вестфальского мира>{65} стали официально признанной конфессией. И всё же маленькая община сумела утвердиться, так как курфюрст и его наместник Радзивилл исповедовали эту религию. В трудных переговорах Фридрих Вильгельм достиг согласия сословий на строительство реформатской церкви в Кёнигсберге. Выдвигалось условие, что она будет находиться не в городе, а за его пределами, и останется единственной реформатской церковью Пруссии. Место нашлось на территории бывшей бойни, принадлежавшей курфюрсту. Начало строительства всё время откладывалось, и первый камень заложили лишь в 1690 году. Принадлежавшая церкви латинская школа была впоследствии преобразована в Бурггимназию. В университет кальвинисты ни в качестве учителей, ни в качестве студентов не допускались, однако в верховных судах они с 1663 года были представлены в качестве заседателей.
Благосклонность курфюрста распространялась и на евреев. В Кёнигсберге никогда не существовало гетто. Маркус Илтен, кёнигсбергский бухгалтер берлинского придворного ювелира Исаака Либманна, основал маленькую, но быстро разросшуюся еврейскую общину. Как и все пришлые люди, евреи проживали не в трёх городах, а только в Замковой слободе. Здесь в 1680 году курфюрст им дозволил основать синагогу и школу. Евреи-студенты допускались и в университет.
Другим результатом суверенитета являлись изменения в организации и полномочиях ведомств: переход от гражданского самоуправления к государственной регламентации. Гораздо чаще, чем раньше, вмешивались власти курфюрста в повседневную жизнь граждан, вводя различные инструкции. Они установили твёрдые цены, улучшили пожарное дело, уборку улиц, принимали меры против шума, который производили на улицах солдаты, подмастерья, молодые торговцы и «подобный праздный люд и негодные мальчишки», нарушая ночной покой граждан. Пытались заодно призвать к порядку нищих и бродяг. Особенно важной, но и трудной была борьба против уличного попрошайничества, ставшее для горожан настоящим бедствием. Выпрашивать милостыню в церквах во время венчаний и крещений, на кладбищах во время похорон строго запрещалось. Духовенству предписывалось оглашать эти запреты с церковной кафедры. Уличное попрошайничество удалось приостановить лишь Фридриху Вильгельму Ⅰ путём введения жёсткого «Положения о бедных». Многие действительно были безработными или не желали трудиться, от них и хотели очистить улицы путём направления на принудительные работы. Этой цели должна была служить тюрьма. Она была построена в 1691 году, но не как место лишения свободы, а как работный дом.
