В арсенал вооружений «Нептуна» входили также: одна 76-мм десантная пушка, весившая 406,4 кг и четыре 47-мм салютные пушки Гочкиса с комплектом холостых патронов с бездымным порохом, рассчитанным на 64 выстрела.
С началом войны в кормовой оконечности квартердека установили две скорострельные (до 20 выстрелов в минуту) 76-мм зенитные пушки QF. Мк I образца 1914 года с длиной канала ствола 45 калибров (3420 мм) патронного заряжания. Орудие стреляло фугасным снарядом весом 7,94 кг с начальной скоростью 617 м/с. Дальность стрельбы составляла 65 кабельтовых (12000 м). Боекомплект орудия, насчитывающий 150 выстрелов, включал два типа снарядов: фугасные и шрапнель. Согласно Списка кораблей Королевского флота в 1916- 1917 гг. сообщалось об установленных в корме одном 76-мм 45-калиберном зенитном орудии OF. Мк1 и одном 102-мм 50-калиберном зенитном орудии QF. Мк VII патронного заряжания, переделанного из противоминного 4-дюймового орудия и имевшего угол возвышения +60°. Боекомплект орудия состоял из 75 снарядов (фугасные и шрапнель).
Отсутствие надлежащего прибора управления огнем делало их практически бесполезным в борьбе с самолетами и они годились, разве что, для обстрела сравнительно тихоходных мишеней вроде «цеппелинов», хотя по оценкам (появившимся после первой мировой войны) британских экспертов, 76-мм и 102-мм скорострельные зенитные орудия, применявшиеся для борьбы с «цеппелинами», также были малоэффективны, поскольку для одного попадания в воздушную мишень требовалось выпустить до 8000 снарядов.
Состав стрелкового вооружения состоял из пяти пулеметов калибра 7,71 мм системы «Максим-Виккерс» образца 1909 года с боекомплектом по 5000 патронов на ствол. Пулеметами вооружались десантные партии при свозе с корабля на берег, при этом пулеметы системы «Максим» устанавливались на съемных станках с поворотной турелью на паровых катерах и баркасах.
Пулеметный расчет состоял из двух человек. Штатное место пулеметов на корабле - на стационарных станках с поворотной турелью на крыльях носового мостика.
По окончании (январь 1911 г.) строительства линейного корабля «Нептун» британское Адмиралтейство приняло решение об оснащении корабля системой управления стрельбой орудий главного калибра с центральной наводкой. Подобная система, впервые разработанная вице-адмиралом Перси Скоттом, еще никогда не применялась на кораблях Королевского флота - «Нептун» был первым. Для этой цели на марсе фок-мачты корабля был установлен закрытый со всех сторон пост, который получил название «командно-дальномерного поста» (КДП), и был предназначен для определения исходных, самых основных данных для наведения орудий на цель.
