.
Граф Д.А. Толстой, имея в подчинении систему светского образования, пытался и духовные школы включить в эту систему, как часть ее: если академии нельзя было прямо заменить богословскими факультетами при университетах, то все же они должны быть превращены в специальные высшие школы по определенной области – богословию. Таким образом, должна быть разрушена целостная система духовных школ, независимая от светского образования, тщательно охраняемая на протяжении второй половины XVIII в. и утверждаемая в первой половине XIX в. Старая система церковной школы, параллельная системе школы государственной, со строгим преемством ступеней, начала разрушаться университетской реформой 1863 г. и семинарской – 1867 г. Созвучна им должна была быть, по мнению обер-прокурора, и реформа духовных академий. У графа Д.А. Толстого было и особое пожелание к проводимой реформе: последовательный приверженец классицизма считал постановку преподавания древних языков в духовной школе старомодной и был уверен в необходимости привлечения к их преподаванию светских специалистов.
На первых заседаниях Комитета были определены главные основания грядущего преобразования: 1) дать академиям больше жизненности и самостоятельности в их внешней и внутренней деятельности; 2) усилить высшее духовное образование введением в академиях специализации преподавания и изучения предметов; 3) открыть доступ в академии лицам всех состояний [сословий – С.Н.]; 4) увеличить оклады наставникам и прочие средства академий. К июню 1868 г. Комитет представил в Святейший Синод проект нового Устава духовных академий с объяснительной запиской. Проект заимствовал отдельные идеи из мнений Конференций, включив их, однако, в совершенно новую концепцию, в которой предполагалось:
• все науки, входящие в состав академий, распределить по трем отделениям: специально-богословскому, богословско-историческому, философскому (§ 3) (в СПбДА учредить четвертое отделение – физико-математическое (прим. к § 3);
• ученые степени специализировать по отделениям, а в отделениях – по группам однородных наук;
• вместо Конференций учредить Советы, дающие право всем профессорам принимать участие во всех делах академии;
• учредить звание приват-доцентов;
• ввести годичный курс вместо двухгодичного;
• открыть доступ в академии лицам всех состояний;
• увеличить все суммы, отпускаемые на духовные академии.
Общеобязательными предметами являлись: 1) Священное Писание; 2) основное богословие; 3) догматическое богословие с историческим изложением догматов; 4) общая церковная история; 5) история философии; 6) педагогика; 7) один из новых языков (французский, немецкий или английский) (§ 105).
