Таким образом, мы видим, что еще со времен Дерптской лекции, а затем и на протяжении всей последующей жизни Э. Крепелин занимал взвешенную и прагматичную научную позицию, находился между двух противоборствовавших тогда в немецкой и австрийской психиатрии идеологических лагерей – радикально-материалистического лагеря и религиозно-мистического, идеалистического лагеря сторонников «психической» школы психиатрии.
Научная позиция Э. Крепелина была одновременно и строго материалистической, и в то же время прагматично допускающей, даже настоятельно рекомендующей, вопреки радикальным материалистам вроде Т. Мейнерта, эмпирическое изучение головного мозга и психики человека как «черного ящика», с помощью методов экспериментальной психологии, а также описательно-феноменологических и клинико-психопатологических методов, по крайней мере до тех пор, пока материальный субстрат психических заболеваний не удастся установить будущими, более совершенными методами исследования анатомии, физиологии и гистологии головного мозга.
Как ученый-прагматик и эмпирик Э. Крепелин последовательно и неутомимо боролся в психиатрии «на два фронта» – как с проявлениями догматического «радикального материализма» учеников В. Гризингера, Б. фон Гуддена и Т. Мейнерта, с попытками свести психиатрию до уровня подраздела невропатологии или нейрофизиологии/нейроанатомии, с «мозговой мифологией» и соответствующей псевдоневрологической, псевдоанатомической терминологией, с фиксацией на посмертном изучении анатомии и гистологии головного мозга больных в ущерб изучению клинической симптоматики, феноменологии, типов течения, исхода и прогноза психических заболеваний, а также, в ущерб изучению психологических феноменов, с методами экспериментальной психологии и факультетской психологии, так и с проявлениями религиозного мистицизма и морализаторства в психиатрии, с попытками свести причины психических заболеваний к «греху» и «наказанию божьему за грехи», с умозрительными психологическими построениями И. Гейнрота и его учеников и последователей, а позднее – и с аналогичными умозрительными теориями З. Фрейда и его учеников о подразделении «души» на различные сущности.
