Для решения важнейших дел созывали Генеральную («полную») раду. Генеральная рада была высшим представительным органом государственной власти Гетманщины. В ее состав входили гетман, старшина, представители рядового казачества, представители православной церкви, иногда представители городов и других государств (посольства). Гетман и старшина, как правило, легко манипулировали Генеральной радой.
Административно Гетманщина разделялась на полки и сотни. Количество полков и сотен не было постоянным. Всего было учреждено 16 полков: 9 на правом берегу Днепра и 7 – на левом. На правом берегу Днепра: Чигиринский, Черкасский, Каневский, Корсуньский, Белоцерковский, Уманский, Брацлавский, Кальницкий и Киевский. На левом берегу: Переяславский, Кропивенский, Миргородский, Полтавский, Прилукский, Нежинский и Черниговский. Со временем территория полков и их названия могли меняться. Неодинаковым было и число сотен. В некоторых полках их было около десятка, в других до двух десятков. Отличалась и численность казаков в сотнях: в некоторых было 200–300 казаков, в других – от двух до нескольких десятков. На Левобережной Украине в 1672 году насчитывалось 117 сотен, а в конце XVII века – 163 сотни.
Главой полка был полковник. Его выбирали казаки полка или назначал гетман. Полковник осуществлял военную, административную и судебную власть. Основным исполнительным органом были полковые канцелярии, куда входили полковые старшины: обозный, два есаула, судья, писарь, хорунжий. Эти чины были выборными. Вспомогательным органом власти был полковой совет казаков и старшин. Сотнями управляли сотники, которых выбирали казаки или назначал полковник. При сотниках существовала сотенная старшина: писарь, хорунжий, обозный, есаул. Существовал также сотенный совет. Судебную власть осуществляли полковые и сотенные суды.
В поселках и селах казаки входили в курень, который выбирал атамана, а селяне и мещане выбирали войта. Атаманы и войты представляли низшее звено войсковой администрации. В городах, как полковых, так и сотенных, был выборный городской атаман. Одновременно существовало и городское самоуправление – магистраты и ратуши, состоявшие из выборных от городского населения.
В конце XVII века на Левобережной Гетманщине было около 2 тыс. населенных пунктов, в которых проживало порядка 1,5 млн человек. Города с Магдебургским правом сохраняли свои права и возглавлялись войтами. В состав городского управления входили бурмистры, райцы и лавники. Другие города и поселки, имевшие самоуправление, назывались ратушными; в то же время в них власть имели казацкие старшины, которым подчинялись казаки.
