Первая партия европейских каторжан, которая оказалась также и последней, прибыла на Андаманы в 1794 году, однако Кид отказался принять ее. Поэтому каторжане вынуждены были вернуться в Бомбей. Со ссылкой на генерал-губернатора решили, что на Андаманские острова не будет сослан ни один каторжанин-европеец, но осужденные индийцы продолжали прибывать; одна из групп в 50 человек была доставлена в ноябре 1794 года.
Однако состояние здоровья жителей поселения продолжало вызывать опасения Совета при генерал-губернаторе. В послании от 14 мая 1794 года генерал-губернатор высказал мнение, что «обстановка в Порт-Корнуоллисе в последний период оказалась весьма неблагоприятной для здоровья поселенцев». Он выразил предположение, что «данное место постепенно, по мере его расчистки станет более благоприятным». Правда, надежды на лучшее будущее не оправдались, потому что во время сезона дождей в следующем году умерло еще 50 человек. Ситуация сложилась серьезная, ее пришлось довести до сведения генерал-губернатора, так как к тому времени корабельный врач Реддих, главный врач поселения, умер, а лейтенант Рамсей вынужден был из-за резко ухудшившегося состояния здоровья уехать в Пенанг.
Теперь генерал-губернатору пришлось смотреть правде в глаза и принимать решения. В конце концов правление Ост-Индской компании зафиксировало в протоколе, что, «учитывая рост заболеваний и смертности в поселении, а также значительные расходы, связанные с организацией снабжения, в настоящий период генерал-губернатор в Совете, руководствуясь соображениями гуманности и экономии, считает благоразумным вывести поселение из этих мест. Поскольку признается целесообразность свертывания поселения, то не следует терять времени, работы должны быть завершены до начала муссона». Далее Совет отметил, что временный уход с Андаманских островов не следует рассматривать как отказ от прав на них и, чтобы на острова не имела права претендовать какая-нибудь иностранная держава (что в данных обстоятельствах маловероятно), необходимо в Порт-Корнуоллисе оставить небольшое судно, экипаж которого сменялся бы каждые шесть месяцев.
Поэтому было решено дать указание морскому совету принять немедленные меры по перевозке каторжан на остров Принца Уэльского и отправке поселенцев и продовольствия в Бенгалию. Затем ему дали указание держать небольшое судно в Порт-Корнуоллисе и менять его экипаж через каждые полгода.
К моменту ликвидации поселения в Порт-Корнуол-лисе по списку насчитывалось 270 каторжан, а также 550 поселенцев (мужчин, женщин и детей), включая нескольких европейцев. В мае 1796 года был окончательно «опущен занавес» над поселением в Порт-Корнуоллисе на Северном Андамане. Никаких сведений о том, было ли оставлено какое-либо судно в Порт-Корнуоллисе, нет.
