.
В 1747 г. Мухаммед-Рахим-бий убил Абулфайз-хана и его наследников и стал эмиром Бухарского эмирата, основателем Мангытской династии. При нем усилилась феодальная раздробленность государства и сократилась его территория.
В XVIII в. независимыми владениями объявили себя Шахрисябз, Гиссар и Бадахшан. Куляб в верховьях Зеравшана оставался полусамостоятельным и управлялся местными правителями[25].
В Бухарском эмирате при эмире Шохмуроде (1785–1800) наступила стабильность, проводились реформы в государственном управлении и экономике. Эмир Шохмурод отвоевал у Ирана Мерв. Воюя со своим братом Умар-бием – наместником Мерва, Шохмурод разрушил Мургабскую плотину и переселил большую часть населения в Самарканд и Бухару, что привело к полному запустению Мервского оазиса.
Эмир Шохмурод совершил несколько военных походов в персидский Хоросан, откуда привез в Бухару много пленных жителей, что способствовало развитию работорговли.
Правление эмира Насрулло (1826–1860) в Бухарском эмирате отличалось постоянными войнами с Хивинским, Кокандским и Шахрисябским ханствами, что нанесло урон хозяйству и культуре Средней Азии.
Кокандское ханство в Ферганской долине расширилось и укрепилось в правление ханов из династии Минг при Алим-хане (1800–1809) и Умар-хане (1809–1822). Алим-хан совершил 15 походов на Ура-Тюбе, воевал с Хорезмом и казахскими ханами, расширил границы Кокандского ханства далеко на север и в 1808 г. захватил Ташкент и земли по берегам р. Чу. В 30-х гг. XIX в. им были завоеваны Каратегин и Дарваз, населенные таджиками.
Бухарский эмир Насрулло вел войны с Кокандским ханством, опустошил Ферганскую долину.
Постоянными были военные столкновения между Шахрисябзским ханством и Бухарским эмиратом. Правитель Шахрисябза захватил часть Яккабага и Чиракчи. Только в 1856 г. эмир Бухары Нас рулло подчинил себе Шахрисябз.
Большинство таджиков Средней Азии проживало в городах Бухарского эмирата и Кокандского ханства, в Ферганской долине, в Бухарском оазисе, в горных княжествах – Каратегине, Вахане, Шугнане, в меньшем количестве в Хивинском ханстве и казахских жузах (в районе Аулие-Аты, Чимкента), в Китайском Туркестане (Кашгаре, Хотане), в Северной Индии и Иранском Хоросане[26].
C XVII в. история таджикского народа связывается с Бухарским ханством, населением которого являлись оседлые таджики и кочевники Дешт-и-Кипчака. Среди кочевых племен преобладали кипчаки.
Дипломатические отношения России, Бухарского и Хивинского ханств начались при Имом-Кули-хане. В 1620 г. он послал эмира Одам-бия в Москву к царю Михаилу Федоровичу Романову, а 23 июня 1620 г. принял российского посла Ивана Хохлова. В Бухаре побывали посольства: в 1669–1671 гг. – братьев Пазухиных, в 1675–1676 гг. – С. Даудова и Касымова.
