Трудно вообразить, что германская эскадра, состоящая в основном из вспомогательных судов под прикрытием пригоршни миноносцев и торпедных катеров, может днем и ночью находиться у Эзеля и Даго, не будучи атакованной ни русскими эсминцами, ни самолетами. По всей видимости, после оставления Ревеля и больших потерь на заграждении «Юминда» все вражеские эсминцы сконцентрировались в глубине Финского залива.
16 сентября эскадра все еще находится в море западнее островов, торпедные катера из-за плохой погоды остаются в Виндаве. На следующие ночи задача катеров заключается в том, чтобы перехватывать пытающиеся спастись вражеские корабли.
В 15.30 17 сентября звено в составе «S-59», «S-57» и «S-54» выходит в море. С 20.30 оно курсирует на расстоянии 4–6 миль западнее Даго. Прожекторам не удается обнаружить катера. Из-за усилившегося до 7–8 баллов ветра группа вынуждена прервать выполнение задачи незадолго до полуночи. Так и не встретив противника, катера в 05.30 прибывают в Виндаву. В следующие ночи они тоже вынуждены оставаться в гавани.
В 19.30 20 сентября командующий крейсерами приказывает перебросить 3-ю флотилию в финский порт Турку, где уже находится 1-я флотилия с кораблем сопровождения «Карл Петерс». В 9 часов следующего утра «S-60», «S-55», «S-54», «S-59» и «S-57» выходят из Виндавы. В 16.00 они подходят к финским шхерам и останавливаются у маяка Утё в ожидании лоцмана. В 18.45 флотилия подходит к «Карлу Петерсу» и пополняет запасы горючего. К сожалению, «S-54» не смог проделать весь путь, вернувшись в Виндаву из-за поломки двигателя.
Опорный пункт в Риге тем временем ликвидируется. «Мозель» и персонал флотилии под командованием обер-лейтенанта Билицера перемещаются в Виндаву. После того как наши армии захватили Ревель и западную часть Эстонии, Рижский залив можно считать вполне безопасным.
В 22.27 приходит еще одна радиограмма от командующего крейсерами — 3-я флотилия временно подчиняется командующему миноносными силами в Хельсинки. Использовать ее, однако, можно только с разрешения командующего крейсерами и только в случае, если советский Балтийский флот попытается прорваться из Финского залива.
В ночь с 22 на 23 сентября возвращенный в строй «S-54» и переданный из 2-й флотилии «S-33» выходят к западному берегу Эзеля вплоть до полуострова Сворбе, где еще держатся крупные силы русских, которые могут попытаться уйти на север или запад на малых судах. В 15.30 катера выходят из Виндавы и в 19.00 прибывают в указанный район. В море не видно никаких плавсредств. Утром слышна артиллерийская дуэль на Сворбе. После выхода из строя одного из цилиндров на «S-33» звено возвращается в Виндаву. Это последняя операция 3-й флотилии в боях с Балтийским флотом.
