Большую популярность обрело увидевшее свет в 1859 году в Петербурге издание «Катехизических бесед», в котором было «преподано учение веры ясное и отчетливое», иначе говоря, общедоступно. Широчайшая известность ждала дневники отца Иоанна, которые публиковались под названием «Моя жизнь во Христе, или Минуты духовного трезвения и созерцания, благоговейного чувства, душевного исправления и покоя в Боге» и которые он вел многие годы.
Терпению и трудолюбию отца Иоанна, который не отличался крепостью тела, зато наделен был величайшей силой духа, казалось, не было предела. Он по многу часов служил в храме, преподавал в гимназии и в воскресной школе, занимался попечительскими делами, много писал — и все успевал!
Господь наделил его еще одним чудесным даром, выражавшимся в способности давать исцеление посредством благословления предметов, даже телеграмм. И когда это стало общеизвестно, в Кронштадт стали приходить телеграммы и письма из всех уголков Российской империи. Количество корреспонденции было велико настолько, что понадобилось открытие специального почтового отделения для переписки отца Иоанна.
День этого неутомимого труженика начинался молитвой после пробуждения в три часа после полуночи. Когда отец Иоанн шел в Андреевский собор, чтобы служить литургию, весь путь его от дома до храма был отмечен встречами с паломниками. Литургии предшествовало покаяние, и ему было уделяемо батюшкой особое внимание, он утверждал, что посредством покаяния прокладывается путь к очищению. Однако в храме скапливалось столько людей, что каждому из них по отдельности отец Иоанн физически не мог дать отпущение грехов. И от него последовало обращение к духовным властям, содержавшее просьбу о разрешении на общую исповедь. Благодаря дару разом и непосредственно воспалять верой своей людей стало возможным подобное исключительное явление. А благодаря «Живому источнику» Н. И. Большакова мы имеем его описание со слов богомольцев, которые бывали в Кронштадте. Вот оно:
«Перед нами было море голов, до пяти тысяч человек. <…> Невозможно описать все личности этой многочисленной толпы, но по большей части она состояла из людей больных телесно или страдающих душевно, притекших сюда с духовною жаждою к источнику благости, добра и милосердия, по воле Господней светло протекающему среди мрачных дебрей нашего многогрешнаго и многострастнаго мира.
Скоро на амвон вышел о. Иоанн с книгою в руках и, обратясь к тысячной толпе народа, звучным, твердым голосом пригласил предстоящих грешников и грешниц к сердечному, искреннему и нелицемерному покаянию.
