Окончательное решение судеб Антиохии было вынесено на совещание предводителей похода, собравшихся в городе между 5–18 ноября 1098 г. Боэмунд потребовал признать его владетелем города, что вызвало оппозицию со стороны Сен Жилля, поддержанного частью собравшихся. Автор «Деяний франков» объясняет это тем, что граф «боялся нарушения своей клятвы императору» [25, 75]. Фактически же Сен Жилль оспаривал у Боэмунда власть над Антиохией. Оба соперника продолжали укреплять контролируемые ими части города[13]. Около 4 ноября после взятия аль Маарры по требованию Сен Жилля состоялось последнее совещание, собравшееся в Ругии (Шастель Руж), куда из Антиохии прибыли Боэмунд, Готфруа Бульонский и Роберт Норманнский. Однако и на этот раз оно завершилось безрезультатно. Возвратившись в Антиохию, Боэмунд силой изгнал из нее оставленных там Раймундом провансальцев, став единоличным хозяином города. К этому времени под его власть перешли оставленные Бодуэном Фландрским и Танкредом в Тарсе, Адане, Мамистре и Александретте гарнизоны. Гийом Тирский датирует поход норманна в Киликию ноябрем 1098 г. [31, 279–280]. Его захваты были признаны наиболее авторитетными из предводителей крестоносных ополчений. Собравшись 2 февраля в Антиохии, они приняли решение о совместном выступлении на Иерусалим из Лаодикеи 1 марта. Боэмунд отказался от участия в походе, предпочтя остаться в своих новых владениях. Прибывшее в начале апреля в лагерь Сен Жилля под Арку посольство Алексея I безнадежно опоздало. Император требовал отложить начало похода до Иванова дня (1 июня), к которому он смог бы лично явиться с армией на помощь крестоносцам, и упрекнул предводителей похода в том, что они нарушили соглашение, санкционировав захват Антиохии Боэмундом [30, 286]. Столь позднее появление византийского посольства у крестоносцев во многом было связано с малоазийским походом императора, в то время не располагавшего достоверной информацией о положении дел при Антиохии.
Сам поход довольно кратко описан Анной Комниной, по-видимому, черпавшей информацию из рассказов участника событий и родственника Иоанна Дуки. Поэтому она лучше осведомлена об освобождении городов долины р. Меандр, нежели о действиях отца в Вифинии.
После разгрома армии султана Рума при Дорилее начался отток сельджуков из прибрежных районов северо-запада Малой Азии — Вифинии, Мизии, Фригии, Памфилии. В городах здесь еще оставались сельджукские гарнизоны, предоставленные собственной участи. К тому же отнюдь не все прибрежные районы принадлежали Руму. Некоторые из них входили в состав независимых сельджукских эмиратов, с которыми Византия уже воевала в начале 90-х годов. Поэтому, воспользовавшись тем, что крестоносцы значительно ослабили Рум, на помощь которого эмиратам уже не приходилось рассчитывать, Алексей I и предпринял поход с целью отвоевания пограничных районов Малой Азии от Вифинии до Памфилии. Частично они были отвоеваны сразу же после прихода его к власти (район Дамалиса), частично утрачены в это время — Каппадокия и Хома, Ираклия Понтийская и Пафлагония [7, 133–134]. Византийская армия была разделена на две части. Большая часть во главе с императором начала изгнание сельджуков из Вифинии, меньшая, действуя совместно с флотом, предприняла освобождение прибрежных районов Фригии и Памфилии. Здесь возглавляемая родственником императора Иоанном Дукой византийская армия двинулась к Смирне, столице сельджукского эмирата, владетель которого Чаха был одним из наиболее опасных противников Византии, захватившим острова Хиос и Самос и построившим флот. Острова были возвращены империи в ходе кампании 1091 г. Чаха погиб. Теперь же, летом 1098 г. византийская армия должна была отвоевать и саму Смирну. Город был сдан без боя после того, как Иоанн Дука поклялся, что жившие в городе тюрки «получат возможность невредимыми вернуться на родину» [7, 303]. После этого был освобожден Эфес. Плененные здесь тюрки были расселены по островам Эгеиды. Преследуя отступавших, Дука вступил в долину р. Меандр, освободив Сарды и Филадельфию. Население сдало ему Лаодикею Фригийскую. Через Хому и Лампи византийская армия вышла в район Поливота. Освобожденные крепости были укреплены или восстановлены, став центрами византийских фем, куда были назначены стратиги [133, 124–137]. В то же время Алексей I завершил освобождение всей Вифинии, выйдя с армией к Филомилию.
