Заложена 14 декабря 1936 года на заводе № 112 (Красное Сормово) в Горьком (Нижний Новгород) под стапельным номером 236 и литерным обозначением «Н-7». 5 апреля 1937 года подводная лодка спущена на воду. 20 октября 1937 года корабль получил литерное обозначение «С-7». 30 июня 1940 года субмарина вступила в строй и 23 июля 1940 года вошла в состав 1-го дивизиона 1-й бригады ПЛ Краснознаменного Балтийского флота.
Еще 19 июня 1941 года «С-7» под командованием капитан-лейтенанта Лисина Сергея Прокофьевича вышла в море для несения дозора в западной части Ирбенского пролива. В 00.55, 22 июня командир субмарины получил сигнал о переводе флота на оперативную готовность № 1, а в 15:45 22 июня получен приказ «О несении дозора по военному времени». О начале войны экипаж «С-7» узнал только 22 июня в 19.59. 23 июня около 23.00 «С-7» обнаружила два торпедных катера, которые дали советские опознавательные сигналы. Это были германские шнелльботы «S-60» и «S-35» из состава 3-й катерной флотилии. Подводная лодка не погружалась, так как командир хотел передать на катера больного краснофлотца. Сблизившись с «С-7», шнелльботы практически в упор с 2 кабельтовых атаковали ее торпедами. Только своевременные и правильные действия верхней вахты спасли лодку от гибели, торпеды прошли в метре от левого борта субмарины. Подводная лодка погрузилась. Катера тем временем вели огонь из зенитных автоматов, а затем сбросили 4 глубинные бомбы. (Через 4,5 часа, после часового боя, эти шнелльботы потопят ПЛ «С-3», которая уходила из Либавы.) Несмотря на то, что лодка получила повреждения, а в VII отсеке возник пожар, который был быстро потушен, она благополучно дошла до Виндавы.
3 июля «С-7» вышла в район между Виндавой и Либавой (позиция № 20). После безрезультатных поисков субмарина вернулась в бухту Триги, а в конце июля перешла в Ленинград и начала подготовку к перебазированию на Север, но 31 августа немцы вышли к Неве, что сделало переход невозможным. Переход через Балтийские проливы в сентябре 1941 года скоро тоже быстро отставили.
С 30 сентября по 21 октября 1941 года «С-7» безрезультатно находилась на «позиции ожидания» между Лавенсари и Гогландом. 27 октября подводная лодка вышла в Нарвскую бухту (позиция № 5/6) с задачей артобстрела береговых целей в районе Нарвы. Для этой цели подводная лодка приняла усиленный артбоезапас, набив снарядными ящиками 1-й и 7-й отсеки. Вечером следующего дня «С-7» подвергла артобстрелу ряд береговых объектов на станции Иеве и в селе Веласте. (Выпущено 44 100-мм и 92 45-мм снаряда.) В дальнейшем подводная лодка неоднократно (30 октября, 2, 6 и 15 ноября) подвергала артобстрелу береговые объекты в районе железнодорожной станции Вайвара, сланцевого завода в Асери, Нарвы, Нарвы-йысуу и Тойлы. (Всего израсходовано 272 100-мм и 184 45-мм снаряда.) Результаты обстрелов остались неизвестными, только 6 ноября при обстреле Нарвы с подводной лодки наблюдали сильный взрыв. Контактов с кораблями противника лодка не имела и 16 ноября вернулась в Кронштадт.
