Действия же немецкой ПЛО, по оценке Ю. Майстера, были неутешительны. Соединения охотников были малочисленны, а их личный состав недостаточно подготовлен. Единственным успехом, пришедшим на долю немцев, стало случайное столкновение в начале января одного из миноносцев с подводной лодкой «С-4». В результате тарана субмарина погибла со всем экипажем.
По официальным советским данным, в 1944 году подводные лодки КБФ потопили 35 транспортных судов общим водоизмещением 86 140 брт., 2 боевых корабля и вспомогательное судно, а в 1945 году жертвой балтийских подводников стали 24 транспорта (97 024 брт.) и 10 кораблей. 1 корабль был поврежден. Современные подсчеты выглядят несколько скромнее: в 1944 году подводниками Балтики потоплено 16 транспортов (35 580 брт.), 1 корабль и 1 вспомогательное судно, в 1945 году 10 транспортных судов (59 410 брт.) и 4 корабля.
Родина высоко оценила вклад балтийских подводников в Победу. В 1945 году звания Героя Советского Союза были удостоены командиры подводных лодок С. Н. Богорад («Щ-310»), М. С. Калинин («Щ-307»), В. К. Коновалов («Л-3»), И.В. Травкин (К-52»). Признание подвига А. И. Маринеско («С-13») и А. М. Матиясевича («Лембит») пришло уже после их смерти спустя много лет после окончания войны. Орденами Красного Знамени были награждены бригада подводных лодок КБФ, подводные лодки «Щ-307», «Щ-310», «Лембит», «С-13» и «К-52».
