В конце сентября — начале октября из финских портов подводные лодки КБФ впервые за полтора года вышли на позиции. В это время немцы проводили эвакуацию Риги (освобождена 15 октября). Бои шли в Курляндии и на полуострове Сворбе (до 22 ноября). В связи с этим перед немцами ставилась задача — снабжение или эвакуация окруженных и прижатых к морю частей и подразделений вермахта. Большую проблему составляла эвакуация гражданских лиц, бегущих от наступающей Красной Армии. Только в сентябре немцам удалось провести суда общим тоннажем 1 809 670 брт. В тот момент, когда вермахт терпел серьезные поражения, германские войска серьезно нуждались в поставках подкреплений и вооружения, медикаментов и продуктов питания. «Котлы» могли получить все это только морским путем. Подводные лодки могли существенно ограничить эти поставки, тем самым помогая Красной Армии в окончательном разгроме врага. Советские субмарины, действовавшие на коммуникациях противника, использовались методом крейсерства в ограниченном районе. В связи с тем, что обстановка на суше иногда менялась достаточно быстро, командование производило переразвертывание подводных лодок из одного района в другой, сосредотачивая их в наиболее напряженных участках вражеского судоходства. Делались попытки организовать взаимодействие подводных лодок и авиации, которая должна была вести разведку в интересах лодок. Однако отсутствие связи между самолетами и кораблями и длительное прохождение информации не давало возможности своевременно воспользоваться разведданными. Непосредственное наведение подводных лодок на обнаруженные цели отсутствовало вовсе. Они действовали самостоятельно, для поиска противника широко применяя гидроакустику.
1945 год стал последним годом жизни рейха. Советские войска рвались к Берлину. Не желая оставаться под советским контролем, население восточных областей Германии спешно покидало свои дома, стремясь уйти на запад. Между тем проводимые мероприятия по «бегству морем» означали дополнительную нагрузку на судовой тоннаж и количество эскортных кораблей, так под ударами советских подводных лодок, торпедных катеров и авиации транспортные суда были вынуждены идти в сопровождении, что повлекло за собой задержки в транспортном обеспечении войск. С 25 января в Мемеле, Пиллау, Данциге, Гдингене началась эвакуация гражданского населения. Через два дня части Красной Армии вышли к побережью Балтики, отрезав Восточную Пруссию от территории рейха. 5 февраля советскими войсками занята Куршская коса, 10 февраля пал Эльбинг, 5 марта советские танки вышли к морскому побережью в Померзнии, немцы отрезаны в Западной Пруссии, 8 марта пали города Штольп и Штольпемюнде, 13 марта советские войска вышли к побережью Данцигской бухты у Путцига и перерезали наземную связь с Хелой. 23 марта пал Цоппот, немецкие войска у Данцига расколоты на три части. 25 марта Данциг покинуло последнее судно. 30 марта Данциг пал. 1 О апреля советскими войсками взят Кёнигсберг, а к середине апреля Кольберг. По данным К. Дёница, за период с 23 января до 8 мая 1945 года из Курляндии, Восточной и Западной Пруссии, Померзнии и Мекленбурга морем было эвакуировано 2 022 602 человека, потери в людях составили менее 0,75 % от числа всех перевезенных на судах гражданских лиц и менее 1 % военнослужащих. Однако такие громкие успехи советских подводников, как потопление «Густлова», «Штойбена» и «Гойи», не могли не оказать определенного морально-психологического воздействия как на лиц, подлежащих. эвакуации, так и на экипажи кораблей и судов, задействованных в мероприятиях по вывозу войск и мирного населения с приморских «котлов».
