Вооружённое выступление заключённых имело свои последствия. На лагерных пунктах и в колониях была существенно усилена оперативная работа по выявлению лиц, подозреваемых в создании повстанческих групп. Началась повсеместная их ликвидация с привлечением к уголовной ответственности.
Значительное осложнение обстановки на фронте в 1942 году потребовало принятия мер, исключающих возможные отрицательные последствия со стороны отдельных категорий граждан. По решению особого совещания при НКВД СССР в июне 1942 года было принято решение, в соответствии с которым граждане СССР, имеющие национальность народов, воюющих против Советского Союза, подлежали направлению в рабочие батальоны до окончания войны. В тех условиях это решение являлось правомерным с точки зрения государственных интересов. Кстати, к аналогичным мерам прибегали и другие страны.
В частности, при известии о трагедии в Перл-Харборе Конгресс США не медленно принял решение об интернировании в концлагерях за колю чей проволокой всех американских граждан японского происхождения. Японцем признавался всякий, в чьих жилах текла одна шестнадцатая часть японской крови. Даже нацисты для проявления геноцида считали достаточным только одной восьмой части еврейской крови. И ведь ни кто не осуждал правительство США, и оно не извинялось перед интернированными японцами. Как видим, отнюдь не в нашей стране была изобретена практика «наказания целых народов». В экстремальных условиях различные государства прибегают к таким мерам и, по всей видимости, ещё долго будут прибегать.
В течение 1942–1944 годов НКВД СССР провёл несколько мобилизаций немцев, финнов, румын с направлением на важнейшие стройки ГУЛАГа и предприятия других наркоматов. Всего за это время было мобилизовано свыше 400 тысяч человек, из которых 220 тысяч направлены для трудового использования в системе НКВД и 180 тысяч на объекты других наркоматов. Действие директивы распространялось и на граждан немецкой национальности, состоявших на службе в рядах Красной армии.
Применение директивы НКВД СССР № 221 1941 года приводило к тому, что в исправительно-трудовых лагерях оседали лица, отбывшие установленный срок наказания. Между тем часть из них вовсе не было необходимости содержать под охраной на положении осуждённых. Этот вопрос получил разрешение в директиве НКВД СССР от 29 апреля 1942 года, которая внесла некоторые уточнения в порядок содержания указанных лиц. Задержанные в местах лишения свободы немцы, итальянцы, румыны, венгры, болгары, латыши, эстонцы, литовцы, выходцы из Бессарабии, судимые по составу контрреволюционных преступлений, подлежали содержанию в лагерях и после истечения срока наказания. Освобождению также не подлежали судимые за антисоветскую деятельность эсеры, меньшевики, анархисты, дашнаки, мусаватисты и члены других антисоветских партий.
