После краткого пребывания в Пловдиве Игнатий уехал в Карлово. Он надеялся, что и на этот раз сможет вернуться к своим обязанностям в церкви, не привлекая к себе особого внимания, но это оказалось нелегко. Он уже приобрел печальную известность, о нем шли людские толки и пересуды, у местных турок дьякон был на подозрении. И вскоре он решил, что и для него, и для семьи будет лучше, если он уедет и где-нибудь переждет, пока оживление уляжется. В середине осени Игнатий вернулся в Пловдив.
Несмотря на то, что в последнее время его занимали главным образом дела военные, дьякон Игнатий страстно хотел учиться. Может быть, общение с широко образованным Раковским, которым он глубоко восхищался, заставило его остро почувствовать пробелы в собственном образовании и вновь пробудило глубоко запрятанную и неутоленную жажду знаний. И хотя ему было уже двадцать шесть лет, Игнатий записался учеником в школу Иоахима Груева и посещал ее всю осень и зиму. На какие средства он жил в это время, неизвестно. Возможно, ему удавалось наскрести денег на свои скромные нужды пением в пловдивских церквях.
Однако дьякон Игнатий посвящал свое время не только учебникам. Уже третью зиму подряд он переживал личный кризис и должен был решить, как жить дальше. Весной 1864 года, не дожидаясь конца школьных занятий, он вернулся в Карлово. Обычно он ни с кем не делился своими проблемами, однако великим постом съездил в Пловдив, к Большому, и сообщил ему, что собирается сложить с себя монашеский сан. Неясно, почему он выбрал именно этот период. Очевидно, ответ на загадку следует искать в характере Игнатия — человека сверхчуткой совести, который в любом деле стремился к максимальной полноте и завершенности. Любые аномалии или противоречия терзали его плоть как тернии; они причиняли боль, беспокойство и их следовало немедленно вырвать. Он психологически не мог носить рясу, зная, что тем самым обманывает других. Решив наконец, что не может выполнять и долг перед церковью, и долг перед народом, Игнатий считал себя обязанным порвать с церковью.
В ночь на пасхальное воскресенье дьякон явился в церковь св. Богородицы служить всенощную и занял свое обычное место на восьмиугольном аналое возле ступеней алтаря. Отсюда ему была видна вся церковь: два ряда колонн, поддерживающих свод; высокий амвон и аналой хаджи Василия по ту сторону придела; патриарший трон, украшенный резными изображениями птиц и виноградных лоз; забранные тяжелыми решетками окна, своды которых были расписаны древним славянским узором из полос красного, черного и белого цвета; высокие алтарные врата, которые отделяли святилище ст молящихся. Никогда дьякон Игнатий не пел так, как в ту ночь. Казалось, его ангельской красоты голос летит к самим вратам рая, увлекая за собой души верующих. Однако никто из них и не подозревал, что творилось в сердце молодого монаха. Знай они его мысли, они были бы глубоко возмущены.
