Для полного осушения ложа пруда ежегодно после осеннего спуска воды расчищают водосборные и водоотводящие канавы. В недостаточно осушенных прудах ложе заболачивается и закисает. Оздоровительные функции выполняет также зимнее промораживание ложа.
При возрастании слоя ила в прудах до 50–70 см и более, его необходимо удалять. В наиболее сухое время года бульдозером снимают слой ила и перемещают его к периферии пруда. В северных регионах России наиболее удобное для этого время — осенние заморозки. Замерзшие слои ила отламывают и кусками вывозят из пруда. Возможно удаление ила из пруда по воде с помощью малогабаритных плавучих землесосных установок. При удалении ила желательно не затрагивать подстилающий грунт. Оптимальный слой ила в пруду составляет 10–15 см. Удаление ила из больших прудов сложный и трудоемкий процесс.
Одним из эффективных мелиоративных мероприятий является аэрация воды. Зимой аэрацию осуществляют с помощью аэрационной установки ИВФ. Для аэрации летних прудов используют аэратор марки "Ерш", который разбрызгивает воду и создает поверхностный ток воды, и аэратор "Винт", который засасывает воздух, перемешивает его с водой и создает направленный ток в толще воды. Все аэраторы применяются для предотвращения заморов рыбы или как технологический прием при высоком уровне интенсификации.
Одним из средств мелиорации является известкование прудов негашеной известью. Ее используют для нейтрализации кислой среды и перевода ее в нейтральную, или в слабощелочную, для дезинфекции прудов и в качестве профилактического средства в борьбе с болезнями рыб. Кислая среда угнетает жизнедеятельность различных групп бактерий, задерживает разложение и минерализацию органических веществ, неблагоприятно сказывается на развитии других гидробионтов. Повышая рН среды до нейтральной или слабощелочной, известь тем самым способствует усилению развития гидробионтов и ускорению минерализации органических веществ. Известь выступает как поставщик кальция, который оказывает существенное влияние на рост и развитие водных организмов, так как входит в состав их скелетных образований и активно влияет на процессы обмена.
Одним из мелиоративных мероприятий является удаление из прудов избытка высших водных растений, чрезмерное развитие которых ухудшает гидрохимический, в частности кислородный режим, повышает кислотность воды, затеняет водоем, препятствуя проникновению света и тепла, сокращает полезную площадь нагула рыбы, что приводит к ее переуплотнению на не заросшей части пруда. В целом эти негативные явления приводят к снижению естественной рыбопродуктивности.
