В числе жертв оказался и бывший виконт де Богарне, шумный и восторженный якобинец и генерал республики, командовавший Рейнской армией. Он был арестован в марте 1794 года и заключен в тюрьму в Карме, где стены были еще забрызганы кровью жертв расправ, имевших место в предыдущем сентябре. Здесь он и оставался, ожидая каждый день услышать свое имя в числе осужденных на казнь, вплоть до 19 июля, когда его, наконец, отправили на гильотину. По иронии судьбы его супруга Жозефина тоже оказалась с ним в тюрьме, хотя они уже давно не жили вместе. Несмотря на его жестокое с ней обращение, она сделала все, что было в ее силах, чтобы спасти Богарне, за что, собственно, и поплатилась арестом. Полагая, что и ее ждет печальная участь супруга, она дни и ночи напролет плакала и причитала у себя в камере, а впоследствии нашла некоторое утешение в страстном романе с другим заключенным, юным, но знаменитым генералом Гошем.
Однако 10 термидора (28 июля) 1794 года Максимилиан Робеспьер и его сторонники были свергнуты заговорщиками, возглавляемыми Баррасом. Заговор оказался успешным, так как буквально все члены Конвента пребывали в страхе за собственную жизнь. Среди тех, кому отрубили голову вместе с Неподкупным, был и его брат Огюстен, почитатель талантов бригадного генерала Буонапарте. 8 августа Наполеон был арестован как сторонник Робеспьера и заключен в форт Карре в Антибе, неподалеку от дома собственной матери. Все его бумаги были конфискованы, и Наполеону реально грозила смертная казнь. Лейтенант Жюно, который во время осады Тулона служил под его началом в качестве сержанта, предложил организовать побег, но Наполеон отказался. Тем временем генерал Дюгоммье, его непосредственный начальник, убедил следствие, что Франции непозволительно терять такого одаренного воина, и Наполеон был помилован. Ему временно было разрешено даже сохранить за собой командование.
В августе 1794 года Жозеф упрочил материальное положение семьи, женившись на Жюли Клари. Невеста настояла на том, чтобы церемонию совершил поставленный вне закона кюре, который в свое время отказался принести присягу на верность Республике.
Игра стоила свеч, ведь слухи о солидном наследстве, полученном невестой, подтвердились к пущей радости семейства Буонапарте, а ее покладистый характер расположил к себе всех их. Ее деверь, генерал, как-то раз назвал ее «лучшей из женщин на всем свете».
Для братьев Буонапарте было настоящей находкой, что по крайней мере одни из них ни в чем не нуждался. В мае 1795 года Наполеон лишился своего места в итальянской армии. Вместо этого ему предложили командование пехотой в Вандее — явное понижение. После отказа его имя вычеркнули из списков боевых генералов, и он был поставлен на половинное довольствие. Наполеон был вынужден снимать комнату в дешевой парижской гостинице, носить потертый мундир и экономить даже на чистке сапог. Перчатки, в то время неотъемлемую деталь туалета, он презрительно отвергал как излишнюю роскошь. Жозеф оказал ему материальную поддержку, однако ее явно не хватало. Наполеон был настолько беден, что, пообедав, заворачивал деньги за еду в листок бумаги, чтобы никто не мог заметить, какие крохи он тратил. Он был больше не в состоянии содержать Луи, которому сумел выхлопотать место в артиллерийской школе в Шалоне. В эти дни Наполеона не раз посещала мысль о самоубийстве. Отчаявшись, он уже начал подумывать о том, а не податься ли ему на службу к туркам. Наполеону казалось, что как только он войдет в доверие к султану, то сможет добиться для Жозефа места французского консула на Хиосе.
