Затем разразилась гражданская война, и в 1532 году войска Атауальпы захватили Уаскара и его сторонников. Но ход событий был нарушен прибытием испанцев под предводительством Франсиско Писсаро, который в конце 1532 года организовал роковую встречу с Атауальпой. Писсаро с горсткой конкистадоров захватил его в плен, назначил выкуп за его голову, а впоследствии казнил, таким образом положив конец инкскому правлению в Перу.
Около 1350 года инки, тогда еще бывшие незначительным племенем, заселявшим малую часть долины Куско, при правлении шестого Инки Рока построили мост через реку Апуримак. Так начался период постепенной территориальной экспансии, который продолжался до 1437 года, когда планы инков столкнулись с серьезным препятствием: при восьмом Инке, Виракоче, они потерпели сокрушительное поражение От соседнего племени чанков. Однако год спустя следующему Инке, Пачакутеку, удалось повернуть ход войны в благоприятную сторону и объединить инкские владения в обширной долине вокруг Куско. Это дало толчок к развитию еще более амбициозных планов расширения государства. За следующие 25 лет Пачакутек значительно увеличил свою империю в результате ряда успешных войн, реорганизации армии и осуществления программы строительства мостов и дорог. Кечуа был объявлен официальным языком, а культ Солнца — официальной религией. В 1463 году армия Пачакутека нанесла поражение племенам лупака и колья, обосновавшимся в Тиауанако на озере Титикака, а в 1466 году разгромила других противников из племени чиму, угрожавших инкам с побережья.
Культ Солнца в империи инков играл центральную роль в системе государственной власти. Слово «инка» означает «солнце», поэтому верховный Инка считался воплощением Солнца на Земле. Бессмертие ожидало тех, кто соблюдал строгий моральный кодекс инков: чистые духом получат вечное блаженство, тогда как нечистые совершат мучительное путешествие к центру Земли и будут искупать свои грехи в нижнем мире.
Тела мертвых сохранялись с помощью мумификации. Мумии часто клали в положении человеческого зародыша для подготовки к возрождению на небесах. Глаза их, как правило, были закрыты в ожидании вступления в дом отца-солнца, залитый великолепным сиянием.
После Конкисты несколько инкских мумий было спрятано; индейцы тайно поклонялись им, к немалому раздражению испанских властей. Гонсало Писсаро нашел и сжег мумию Инки Виракочи в селении Йакуджауана, где он сам был впоследствии повешен. В 1559 году Хуан Поло де Ондегардо, коррехидор (главный судья) Куско, обнаружил, что пепел Виракочи пользуется у индейцев еще большим почтением, чем мумия усопшего правителя. Впоследствии Хуан Поло нашел другой тайник с мумиями трех Инков и четырех «сестер-жен» (
