Михаил Кедров и представить себе не мог, что в сталинские времена его самого арестуют точно так же — без какой-либо причины, а после оправдания в суде (что само по себе было невиданным делом!) все равно расстреляют… А тогда чекисты одолели главкома. Особый отдел ВЧК арестовал бывшего офицера, состоявшего при Вацетисе, и доложил Дзержинскому, что в Полевом штабе Реввоенсовета созрел белогвардейский заговор. Председатель ВЧК доложил о заговоре Ленину, тот подписал приказ об освобождении Вацетиса.
Вместе с Вацетисом были арестованы начальник Полевого штаба Федор Васильевич Костяев (Полевой штаб РВС существовал с 22 октября 1918 года и руководил всеми боевыми операциями) и еще несколько ключевых штабистов. Эти аресты были проведены летом 1919 года, когда положение на фронтах было отчаянное! Доволен был, кажется, один Сталин, который торжествующе писал Ленину: «Не только Всероглавштаб работает на белых, но и Полевой штаб Реввоенсовета Республики во главе с Костяевым».
Обвинения против Вацетиса, как и следовало ожидать, оказались липовыми. Но советская власть своих ошибок не признавала. 7 октября 1919 года ВЦИК принял постановление:
«Поведение бывшего главкома, как оно выяснилось из данных следствия, рисует его как крайне неуравновешенного, неразборчивого в своих связях, несмотря на свое положение. С несомненностью выясняется, что около главкома находились элементы, его компрометирующие.
Но, принимая во внимание, что нет оснований подозревать бывшего главкома в непосредственной контрреволюционной деятельности, а также принимая во внимание бесспорно крупные его заслуги в прошлом, дело прекратить и передать Вацетиса в распоряжение военного ведомства».
Освободили и остальных офицеров, дела прекратили за отсутствием состава преступления. Но ущерб для Красной армии был значительным. В 1938 году чекисты вспомнят о былой близости Вацетиса, который преподавал в Военной академии имени М.В. Фрунзе, к Троцкому, и бывшего главкома расстреляют.
После Вацетиса главкомом стал Сергей Сергеевич Каменев, еще один выпускник Академии Генерального штаба, который тоже командовал в царской армии полком. 1 апреля 1918 года он вступил в Красную армию, в сентябре сменил Вацетиса на посту командующего Восточным фронтом и сражался против войск адмирала Колчака.
Весной 1919 года Сергей Каменев вступил в конфликт с Троцким, отказавшись исполнить приказ прекратить наступление на Восточном фронте, чтобы можно было перебросить силы на Южный фронт против Деникина. За невыполнение приказа Троцкий отстранил его от должности:
