Рудольф был снисходителен даже к откровенным шарлатанам: он не казнил ни одного алхимика, хотя неудачливых иногда арестовывал за долги или запрещал им въезд в страну. Одним из самых колоритных персонажей того времени был грек Мамунья из Фамагусты — мошенник, представлявшийся магом и алхимиком, сыном венецианского вельможи. Он никогда не расставался с двумя черными псами-мастифами, наводившими ужас на пражан, которые считали, что это звери из преисподней.
Приехал в Прагу и Джеронимо Скотта, выдававший себя за прославленного в Италии некроманта — человека, способного общаться с мертвецами. Сначала он был обласкан при дворе, однако вскоре открылась его беспомощность в тайных науках, и Скотта закончил свою эскападу в роли торговца пряностями на Староместской площади.
Видным ученым при дворе Рудольфа II был член ордена розенкрейцеров Михаэль Майер. Автор нескольких трудов по алхимии, он был не только личным врачом короля, но и композитором. Алхимические тексты на латыни перекладывали на музыкальные фуги и каноны, написанные Майером, и исполняли в лабораториях во время проведения алхимических опытов. Обладавший широчайшими познаниями в области естественных и эзотерических наук, Майер был также весьма талантливым поэтом, сочинителем латинских стихов — как в классическом, так и в средневековом, или рифмованном, стиле. Кроме того, он был превосходным музыкантом и композитором, знатоком классических принципов гармонии. И все эти способности, вместе со своей страстью к чудесному, он принес на алтарь самой главной для него науки — алхимии.
Встречались при дворе императора и гении, вошедшие в анналы мирового искусства и науки. Это живописец-маньерист и изобретатель Джузеппе Арчимбольдо по прозвищу Великолепный — предтеча сюрреализма и авангардизма XX века. Сам Сальвадор Дали считал его своим учителем. Портреты-натюрморты итальянца поражают воображение. На картине Арчимбольдо император предстает как аллегория римского бога перемен Вертумна из… фруктов, цветов, овощей и злаков. Арчимбольдо был главным распорядителем и «главным инженером» знаменитых на всю Европу рудольфинских карнавалов. Он занимался изобретениями в области гидравлики и проектировал музыкальные автоматы.
По заказу Рудольфа II итальянский архитектор Джованни Мария Филиппи строил испанский зал во втором дворе Градчан. Император руководил реконструкцией своей резиденции и великолепных садов в ее окрестностях. А в Математической башне, рядом с покоями монарха, хранилась уникальная коллекция редчайших минералов.
