.
Говоря о структуре "Преображенского приказа" можно отметить, что окончательно она сложилась к 1698 году. Возглавлял приказ "Главный судья". Приказ состоял из трех частей: Генерального и Потешного дворов и Главной канцелярии. "Генеральный двор", возглавляемый генералом Головиным, занимался управлением деятельностью Преображенского и Семеновского гвардейских полков.
"Потешный двор", являлся высшим полицейским органом для Москвы. Осуществлял назначение нарядов из числа гвардейских солдат для несения караулов на улицах Москвы. В "Потешный двор" приводили лиц, обвинявшихся жителями в совершении уголовных преступлений. Пять подьячих "Потешного двора" производили осмотр и опрос пострадавших, допрашивали обвиняемых и в зависимости от степени вины задержанных тут же назначали наказание (обычно разное число ударов кнутом или денежный штраф). Если преступление было более тяжким, отсылали задержанного в судебные приказы. Доходы от штрафов были настолько велики, что позволяли удовлетворять большую часть текущих расходов всего "Преображенского приказа". Деятельность "Потешного двора" в Москве продолжалась до 1711 года, когда он был упразднен.
Собственно политическим сыском в Преображенском приказе занималась "Главная канцелярия". Через нее осуществлялась связь всего приказа с остальными правительственными учреждениями. В ее ведении находились "колодничьи избы" (тюрьмы) Преображенского приказа, управление Потешным двором, хозяйственные и финансовые дела, приказа. В канцелярии работали два дьяка ("старший дьяк" и "дьяк — помощник") и около 10 подьячих.
Первым дьяком Главной канцелярии в 1695–1697 годах был Петр Тютчев, до этого служивший в "Московском судном приказе" В 1697 году новым дьяком канцелярии стал Яков Никонов. С 1697 года и до упразднения приказа дьяком канцелярии был Василий Нестеров. Дьяк, возглавлявший "Главную канцелярию" являлся первым заместителем главного судьи (начальника) Преображенского приказа. В его отсутствие он исполнял его обязанности. Дьяк получал 160 рублей в год, что было гораздо больше, чем у его коллег из других приказов. Прежний размер его жалования деньгами и продуктами был, сохранен и после 1704 года, когда было проведено общее снижение окладов правительственным чиновникам.
Подьячие приказ были весьма загружены по тогдашним меркам, каждый из них вел от 10 до 45 дел в год, из которых больше половины были политические.
В штат Преображенского приказа также входили 4 сторожа, 2 лекаря и лекарский ученик, 4 конюха, 16 рабочих (токари, плотники, кузнецы и другие)
