По настоянию Ленина, в качестве одного из ведущих корреспондентов "Искры", был назначен Бонч-Бруевич. Он писать туда статьи под псевдонимом "Северянин". А сам Ленин уехал в Германию, чтобы приступить к непосредственному изданию "Искры". Первый номер газеты вышел в Лейпциге 11 декабря 1900 года.
В апреле 1902 года, после того как германское власти по настоятельному требованию российского министерства иностранных дел запретило издавать "Искру" на своей территории, её редакция переехала из Мюнхена в Лондон, а в 1903 году в Женеву. Там Бонч-Бруевич сразу же стал ее постоянным сотрудником. Это было удобно, тем более, что и "Искра", и газета "Русское студенчество", в которой он уже давно состоял, печатались теперь в одной и той же типографии "Освобождения труда".
В 1903 году, Бонч-Бруевич вошел в созданную Лениным "Заграничную лигу русской революционной социал-демократии". Эта организация была создана Лениным для того, чтобы объединить в единый кулак все русские революционные организации, действовавшие в эмиграции. А когда в этой организации после раскола РСДРП возобладали меньшевики, Бонч-Бруевич столь же дисциплинированно ушел вместе с другими большевиками со второго съезда этой организации.
Одновременно Бонч-Бруевич вместе с женой выполняли важное задание Ленина: поднять на борьбу против царизма сектантов. Для этого они вновь отправились в Канаду, где встретились с руководителем большой группы секты "Духоборов" возглавляемой П. В. Веригиным, и почти два года прожили среди сектантов, изучая их верования и обряды и примеряясь, как бы лучше приспособить их движение для революционных целей и превратить сектантов в резерв революции. Им удалось сделать многих сектантов подписчиками "Искры", после чего они возвратились в Женеву и продолжили подготовку к революции.
Важной вехой в жизни Бонч-Бруевича стал II съезд Российской социал-демократической рабочей партии (РСДРП). Он написал для II съезда РСДРП, специальный доклад "Раскол и сектантство в России". После раскола РСДРП на сторонников Ленина (большевики) и противников (меньшевики), и последовавшей затем драматичной борьбы Ленина с меньшевиками, Бонч-Бруевич сразу же примкнул к большевикам.
Зарекомендовав себя как абсолютно надежный и преданный Ленину человек, он был назначен им заведовать, находящимися в Женеве — типографией, издательством, а так же специальной мастерской по изготовлению поддельных документов, прежде всего паспортов, пересылкой в Россию партийной литературы. Теперь вся революционная литература, которая поступала в страну, проходила через его руки. Да и сами революционеры тоже — он снабжал их паспортами, проездными документами, деньгами.
