Основу источниковой базы исследования составляют архивные документы, значительная часть которых впервые вводится в научный оборот. Из документации высших органов власти использовались постановления Государственного комитета обороны, оригиналы которых вместе с подготовительными материалами хранятся в Российском государственном архиве социально-политической истории[73], а за время работы над диссертацией стали доступны онлайн[74].
Ведомственная документация НКВД СССР отложилась в Государственном архиве Российской Федерации[75]. Часть приказов НКВД продолжает оставаться на секретном хранении, часть находится в центральном архиве ФСБ РФ. Небольшая часть приказов о создании спецлагерей и изменениях системы проверки была издана[76]. Часть документов, относящаяся к деятельности НКВД, отложилась в до недавнего времени засекреченных делах из секретариатов Л.П. Берии и К.Е. Ворошилова как заместителей председателя СНК[77].
Документация подразделений самого НКВД, которым в разное время подчинялись спецлагеря, оказалась рассредоточена в нескольких архивах. В отделе спецфондов ГАРФа хранятся документы отдела спецлагерей (позже переименованного в отдел проверочно-фильтрационных лагерей)[78], в общем читальном зале доступна микрофильмированная документация главного управления лагерей НКВД[79]. Ряд документов о работе ГУЛАГа изданы[80]. Документы управления по делам военнопленных и интернированных хранятся в Российском государственном военном архиве[81], отдельно — документация политотдела[82]. Часть документов о работе УПВИ, посвященная военнопленным, издана, и в них также есть материал о работе со «спецконтингентом»[83].
В качестве документации конкретных спецлагерей, помимо содержащейся в вышеуказанных фондах, использовались документы из Центрального государственного архива Московской области: отдельный фонд по Подлипкинскому ПФЛ № 0303[84] и фонд областного УНКВД, в котором в две отдельные описи выделены дела о проверочно-фильтрационных лагерях[85].
Указанная ведомственная документация состоит из распоряжений, директив и приказов начальников УПВИ/ОПФЛ/ГУЛАГа, отчетов лагерей и посещавших их инспекций, запросов по спорным вопросам, жалоб проверяемых, переписки между лагерями и хозяйственными объектами. Эти документы касались трудового использования, режима, политработы и настроений, медико-санитарного состояния и других вопросов содержания «спецконтингента».
Для освещения деятельности сборно-пересыльных пунктов были использованы хранящиеся в Центральном архиве Министерства обороны РФ документы штаба тыла Западного фронта
