В 1942 г. началось трудовое использование проверяемых в спецлагерях, открываются первые «производственные» объекты, происходят первые передачи прошедших проверку в постоянные кадры промышленности. Результаты трудового использования, очевидно, удовлетворили руководство НКВД, и содержащиеся в спецлагерях «бывшие военнослужащие» начинают рассматриваться не как лишние рты, а в качестве ценного ресурса.
Осень 1942 г. характеризуется общим упадком системы фильтрации: передача функций СПП другим тыловым объектам, закрытие спецлагерей, отсутствие новых проверяемых. Однако 1943-й стал годом не ликвидации, а коренных изменений в работе системы. Начался он с реформы, благодаря которой большинство бывших пленных и «окруженцев» вливались напрямую в воинские части через СПП или даже в обход всяких фильтрационных учреждений. Вновь возросла роль в проверке фронтовых особых органов.
На развертывание новых и работу существующих спецлагерей ключевое влияние стали оказывать соображения трудового использования проверяемых. За исключением Феодосийского № 0187 и Таллинского № 0316, линия фронта и ход боевых действий не оказывали влияния на развертывание сети спецлагерей с конца 1943 г. Отправленные в спецлагеря рисковали даже после завершения проверки оказаться приписанными к объекту промышленности. Вся система теперь состояла из элементов с противоположными задачами и теряла свой первоначальный смысл. Особенно это было заметно на лагерном уровне, где с ноября 1943 г. новые контингенты «коллаборационистов» и «лиц призывных возрастов» как Наркомат обороны, так и Управление военного снабжения НКВД отказались снабжать («ссылаясь на то, что они не являются контингентами Наркомата обороны»), а управления СМЕРШ — проверять[512].
В 1944 г. данные тенденции сохраняются. В УПВИ появляются идеи о реформировании системы путем ликвидации спецлагерей. Однако вместо этого перед началом репатриации лагеря были переданы в ведение ГУЛАГа, а затем и самостоятельного отдела спецлагерей НКВД. В систему включаются пограничные проверочно-фильтрационные пункты НКВД для организации возвращения советских граждан на родину. Осенью 1944 г. принимается решение о направлении основной массы «бывших военнослужащих» для проверки вместо спецлагерей в запасные части НКО.
В мае 1945 г., с окончанием военных действий, фильтрация основной массы контингентов была окончательно передана неспециализированным органам — СМЕРШу в запасных армейских частях и местным органам госбезопасности в рабочих батальонах и по месту жительства репатриантов. ПФП превращались в пограничные контрольные пункты, а ПФЛ, с точки зрения организации проверки, становились лишним элементом децентрализованной системы. И хотя с окончанием войны для их существования не было никаких контрразведывательных обоснований, на протяжении всего 1945 г. их сеть будет расширяться. Рабочие батальоны, массовая отправка проверяемых в ИТЛ, работа местных органов госбезопасности и сложности с закрытием ПФЛ характеризовали послевоенный период существования системы проверки, для некоторых проверяемых закончившейся только к 1949 году. Оперативные мероприятия в отношении бывших пленных, «окруженцев», «коллаборационистов» и репатриантов продолжались и в дальнейшем, но для них уже не создавалось специализированных учреждений.
