В конце концов, находящийся уже в звании генерала Михаилович, был снят эмигрантским правительством со всех командующих постов. Невзирая на это, он продолжал вооруженную борьбу вплоть до марта 1946 года, когда его отряд был разгромлен силами Броза-Тито уже после занятия Югославии Красной Армией. Драголюб Михаилович был казнен после суда, не учитывавшего показания спасенных четниками пилотов американских ВВС (всего которых было около 500 человек), 15 июля 1946 года.
Существуют версии, что именно с именем Драголюба связаны этнические чистки на Балканах, а также зверства по отношению к мирному населению – а именно к мусульманам и католикам (преимущественно хорватам), проживавшим на Балканах. Однако в этом вопросе нельзя не учесть ряд факторов, среди которых не последнее место должно занимать истребление сербского народа в концентрационных лагерях, созданных подконтрольным нацистской Германии правительством хорватских усташей в годы Второй Мировой войны, а также тот факт, что «историю пишут победители». Четники же потерпели поражение.
