После полудня отряд вновь отошел, взяв курс на Лиепаю для дозаправки и пополнения боезапаса. В 14:27, когда корабли находились в в 20 милях к западу от Виндавы (Венспилс), наблюдатели с "Лейпцига" заметили следы торпед с правого борта. Крейсер резко отвернул влево и пропустил торпеды по носу, в го время как миноносец эскорта Т-7 атаковал глубинными бомбами советскую ПЛ "Щ-317". Обе стороны разошлись "вничью", не пострадав. Вечером отряд без дальнейших происшествий достиг Лиепаи. Для "Лейпцига" боевая деятельность закончилась: 28 сентября оба крейсера вышли в море в сопровождении двух миноносцев, а на следующий день "Лейпциг" в эскорте "Т-11* прибыл в Киль, где ему предстояло пройти профилактический ремонт и чистку днища.
Крейсер оставался в доке до 20 октября, а по выходе вновь приступил к тренировочной службе. Из-за "ущербной" скорости его активное использование для боевых целей не предусматривалось.
Фронт ушел далеко на Восток, и "Лейпциг", остававшийся в восточной части Балтийского моря, не имел противников. Рутинная, без сколь-нибудь ярких эпизодов, служба продолжалась. С 11 апреля 1942 г на крейсере поднял флаг начальник учебных сил флота, контр-адмирал Лейтцман. В конце 1942 - начале 1943 г корабль находился на очередном профилактическом ремонте на заводе "Дойче Верке" в Киле, а 4 марта 1943 г его перевели в Либаву (Лиепаю), где "Лейпциг" был выведен в резерв.
После 5-месячного бездействия в медленно протекавшем ремонте, корабль вновь вошел в строй 1 -го августа, теперь - под командованием капитана цур зее Хюльземанна. Весь август и сентябрь крейсер проходил послеремонтные испытания механизмов и оружия. Фактически к регулярной службе "Лейпциг" приступил только в октябре. Затем вновь потянулись будни учебы и подготовки специалистов. В январе 1944 г последовал очередной ремонт на заводе "Дойче Верке" в Готенхафене, в ходе которого особо тщательному осмотру подверглась артиллерия главного калибра, стволы которой уже однажды были сменены (в апреле-мае 1942 г). За ремонтом прошли обычные испытания, и только в марте "Лейпциг" вновь стал полноправным членом "учебной команды". К концу года крейсер находился все в той же роли, только сменив командира (им с 26 августа 1944 г стал капитан цур зее Шпорель).
Мощное наступление Советской Армии, заставило зашевелиться все мало-мальски боеспособные корабли. Но вновь в числе участников обстрела побережья "Лейпцига" не оказалось. Для него нашлась, казалось бы, более спокойная задача: усилить минные заграждения в Датских проливах, поскольку Верховное командование ожидало высадки союзников на Ютландском полуострове. Для окончательной "доводки" пришлось поставить крейсер в док, и он был готов к действиям только 14 октября. На следующий день он вышел из Готенхафена и взял курс на Свинемюнде, где следовало принять мины и следовать затем в Скагеррак, подальше от Восточного фронта.
