Последние годы жизни Аполлоний Тианский провел в Эфесе, окруженный множеством учеников. Там он видел духовными очами, как убивают Домициана приближённые, возвестил присутствующим смерть тирана и в письме к Нерве дал новому императору советы о правительственных делах, Потом он уединился от взора людей, чтобы умереть без свидетелей, а Дамида послал в Рим, сказав ему: «Хотя ты и будешь философствовать по собственным понятиям, но имей всегда перед глазами меня».
Аполлоний Тианский у Филострата напоминает Иисуса Христа многими чертами. Он сын Божий; он одарен предвидением будущего и силой совершать чудеса, изгоняет демонов из бесноватых, воскрешает мертвых (он воскресил в Риме дочь бывшего консула, которую несли хоронить). Он ходит по городам, окруженный учениками; ученики его веруют, что он имеет власть над бурей и огнем. Аполлоний совершает чудеса только для блага других, не для своей пользы. Его чудеса служат опорой веры его учеников; они совершаются не силой натуралистической магии и не чародейством, а исключительно божественной силой чудотворца. Подобно Иисусу Христу, Аполлоний был предан одним из своих учеников (Эвфратом) и подвергнут суду. В рассказе о взятии его под стражу и о допросе его на суде многие подробности напоминают рассказы евангелистов (его допрашивал император; одним из обвинений против него было то, что некоторые считают его за бога). Как Иисус говорил о себе, что пришел не разрушать, а исполнить закон, так и Аполлоний не разрушал прежнюю веру, а только преобразовывал ее на основании древней философии, в частности, на основании систем Пифагора и Платона, чьи высокие учения о Боге, устройстве вселенной, нравственных обязанностях человека он вновь возвещал людям. Аполлоний Тианский, подобно Пифагору и Платону, требовал от своих последователей чистой нравственности, добродетели, человеколюбия, самопознания, повиновения голосу совести. Он так сильно возвышается над людьми, что надо считать его существом сверхъестественным, – богом, как и признали его индийские мудрецы еще в его молодости. Это подтверждается и таинственным исчезновением его. Сходство казалось так велико, что в конце III века Гиерокл, правитель Вифинии, отличавшийся свирепостью во время гонения на христиан при Диоклетиане, написал рассуждение «Слова любви к истине», в котором противопоставлял Иисусу Христу Аполлония Тианского, божественною мудростью и силой совершившего великие чудеса, наставника и благодетеля людей.
