Найденное в процессе работы над Як-125Б размещение кабины штурмана конструкторы ОКБ-115 применили и на фронтовом разведчике Як-125, что позволило устранить замечание макетной комиссии относительно обзора. Фотоаппаратуру разместили перед штурманом и за кабиной пилота в среднем отсеке фюзеляжа. Вооружение и шасси остались прежними, но взлетный вес увеличился. 10 марта 1955 г. Совмин выпустил Постановление №448-271, согласно которому ОКБ Яковлева и саратовский завод №292 должны были построить 10 разведчиков Як-25Р войсковой серии. На испытаниях взлетная масса самолета с двигателями РД-5А составила 9840 кг, а максимальная скорость - 1080 км/ч. Ведущим инженером по самолету был Н.Г.Колпаков, ведущим летчиком-испытателем - Ф.Л.Абрамов. После окончания испытаний стало ясно, что Як-125 все же не имеет решающих преимуществ по сравнению с основным советским фронтовым разведчиком Ил-28Р. Самолет в крупносерийное производство запускать не стали, сделав ставку на новую сверхзвуковую машину.
В годы «холодной войны» руководство Советского Союза отводило авиации важную роль в борьбе с потенциальным противником и на море. Учитывая, что морской разведчик «89» ОКБ-156 А.Н.Туполева (на базе Ту-14) так и не был принят на вооружение, а Ил-28Р имел невысокую скорость, было принято решение поручить КБ Яковлева создать на базе серийного Як-25 скоростной морской разведчик Як-25МР. Соответствующее Постановление Совмина №1968-911 вышло 18 сентября 1954 г., а приказ МАП №597 - 21 сентября. В этих документах особое значение придавалось скорости и высоте полета, которые требовалось получить не ниже, чем у базового перехватчика. Срок предъявления нового самолета на госиспытания устанавливался в феврале 1955 г.
Разработка морского разведчика началась в 1954 г., а эскизный проект был утвержден 4 марта 1955 г. Постройку опытного самолета на базе серийного планера завершили в короткий срок. Конструктивно ЯК-25РМ отличался следующими изменениями: удлиненной на 0,5 м носовой частью фюзеляжа для размещения аэрофотоаппарата АФА-33/75М; новой радиолокационной поисковой станцией СПРС-1 «Курс» с фотоприставкой ФА-РЛ-1 (антенна РЛС размещалась в носу самолета и закрывалась радиопрозрачным обтекателем); ответчиком СРЗО-1 вместо ответчика СРО; наличием станции оповещения об облучении РЛС «Сирена-2с»; составом радиооборудования; отсутствием левой пушки Н-37Л и тормозных щитков; размещением в нише левого тормозного щитка спасательной лодки ЛАС-5М. Поисковая РЛС предназначалась для обнаружения группировок кораблей и одиночных судов (что фиксировалось фотоприставкой с экрана локатора). АФА-33/75М позволял снимать корабли при скоростном пролете над ними. Предполагалась и установка аэрофотоаппарата АФА-33/50 для перспективной съемки. Заводские испытания морского разведчика завершились летом (отчет утвержден 25 июля). Як-25МР показал преимущества перед Ил-28Р по скорости примерно на 170-200 км/ч, по практическому потолку - на 2400 м, уступив ему по дальности полета. Биография самолета завершилась аналогично Як-125 по сходным причинам.
