В канун нового 1966 года Логинов, ставший к этому времени майором, на теплоходе «Каменск» отплыл из Ленинграда в Антверпен, а затем уже как Эдмунд Тринки 27 января 1967 года вылетел в Йоханнесбург. Там он получил сообщение из ЦРУ, в котором ему предлагалось выехать в Кению для встречи с новым куратором Питером Капустой. Но Логинов не знал, что перед Капустой была поставлена задача найти доказательства того, что он является засланным агентом КГБ. Встреча Логинова и Капусты состоялась в мае 1967 года в Найроби. В течение нескольких недель они ежедневно беседовали с 9 часов утра до 8 вечера. Результатом этих бесед стала уверенность Капусты в двойной игре Логинова. «Я был уверен в его нечестности и неискренности, – позднее вспоминал Капуста. – Он находился не на нашей стороне и всегда сохранял лояльность КГБ. Буквально все, что он рассказывал, вызывало у меня сомнения».
В июне 1966 года Логинов вернулся в Йоханнесбург, а Капуста – в Вашингтон, где доложил о своих подозрениях начальнику советского отдела Дэвиду Мэрфи и директору ЦРУ Энглтону. И после этого руководство ЦРУ приняло из ряда вон выходящее решение. Энглтон, Мэрфи и начальник оперативного управления ЦРУ Фитцджеральд, уверенные, что Логинов – подстава КГБ, решили «заложить» его контрразведке ЮАР.
В июле 1967 года сотрудники БОСС (полиция безопасности ЮАР) ворвались в квартиру Логинова на Смит-стрит и арестовали его. Он был отправлен в тюрьму, где его подвергали интенсивным допросам. А 9 сентября 1967 года объявили, что Логинов признался в шпионаже против ЮАР и еще 23 стран. Шеф полиции БОСС генерал-майор Хендрик Дж. Ван дер Берг огласил длинный список советских дипломатов в других странах, которых Логинов якобы опознал как сотрудников КГБ. Фактически же имена офицеров КГБ передали БОСС американцы. Они были выбраны из досье ЦРУ и поступили совсем не от Логинова. Выдача имен, по словам одного из сотрудников ЦРУ, преследовала одну цель – как можно больше очернить Логинова в глазах КГБ. В тюрьме ЮАР Логинова допросил также и Эванс, выступавший под видом представителя БОСС. Однако, несмотря на все старания, ему не удалось добиться от Логинова признания в том, что он агент-двойник. А поскольку все доказательства были предоставлены ЦРУ и не могли быть использованы в суде, то перед Энглтоном возникла проблема – что делать с Логиновым дальше.
И тогда ЦРУ предложили обменять его на кого-нибудь из арестованных в СССР. Власти ЮАР согласились.
