Совместными усилиями казаков, местного населения и подошедших войск русскому командованию удалось отстоять Благовещенск и воспрепятствовать вторжению противника на российскую территорию в других местах. За проявленное мужество несколько десятков казаков и все казачки, которые несли службу на границе, были награждены серебряными медалями «За храбрость» на Георгиевской ленте[28]. Казачьи части и подразделения, непосредственно участвовавшие в военных действиях, также были высоко отмечены командованием. Серебряные Георгиевские трубы получили три сотни Аргунского, две сотни Нерчинского, сотня Верхнеудинского полков, батарея Забайкальского казачьего войска и три сотни Амурского полка Амурского казачьего войска. Кроме того, специальных знаков отличия на головные уборы были удостоены две сотни Верхнеудинского, сотня Читинского и вторая батарея Забайкальского казачьего войска, а также сотня Амурского полка Амурского казачьего войска[29].
К 20-м числам сентября 1900 г. активные боевые действия российских войск в Северо-Восточном Китае были в основном завершены. Главные силы повстанцев разгромлены, контроль над КВЖД восстановлен. Бремя военных неудач заставило цинское правительство Китая порвать с вождями ихэтуаней. 7 сентября был издан императорский указ, обвинявший повстанцев в создавшейся в стране ситуации и предписывавший местным властям беспощадно с ними расправляться. Все основные районы Маньчжурии были взяты под контроль российскими войсками. Казачьи части и охранная стража вернулись к исполнению своих прямых обязанностей.
После этого в рядах ихэтуаней остались лишь немногие наиболее стойкие бойцы, которые продолжали борьбу под лозунгом: «Долой Цин, смерть иностранцам, да здравствует Китай!» Карательные экспедиции против них продолжались до 1902 г. Охранная стража в это время вела лишь частные боевые действия по уничтожению в охраняемой полосе отрядов хунхузов. Например, в декабре 1901 г. поступили данные о наличии в деревне Тунь-Ди-Анза хунхузов. В связи с этим туда было направлено 54 стражника во главе с поручиком Конэ. Узнав о приближении русских, разбойники под видом крестьян покинули деревню, в которой при обыске были найдены 47 винтовок, 23 охотничьих ружья, 32 фальконета[30] и деревянная пушка. Потеряв такое количество оружия, хунхузы были вынуждены надолго прекратить нападения на линию железной дороги[31].
В декабре 1900 г. начались переговоры цинского правительства с представителями империалистических держав. В них наряду с восемью государствами-интервентами участвовали также Бельгия, Голландия и Испания. Из-за острых противоречий переговоры длились девять месяцев. И только 7 сентября 1901 г. был подписан Заключительный протокол. По его условиям на Китай налагалась непосильная для него контрибуция сроком на 39 лет, а иностранным государствам предоставлялось право содержать свои войска на его территории. Русское правительство получило возможность завершить строительство КВЖД и осваивать прилегавшие к ней районы. В результате этим документом было окончательно закреплено полуколониальное положение Китая и дан толчок новому витку противоречий между империалистическими странами за влияние в Дальневосточном регионе.
