Обособленным подразделениям необходимо предоставлять за каждый отчетный период в головную организацию данные для оформления единых журналов и книг и составления налоговой декларации по НДС.
Обособленным подразделениям, не выделенным на отдельный баланс, запрещается выписывать счета-фактуры и вести их учет. Для определения налоговой базы по НДС они должны передавать головной организации в установленные сроки счета-фактуры, полученные ими от поставщиков.
Если компания и ее обособленные подразделения ведут операции как облагаемые, так и не облагаемые НДС, в налоговой политике нужно определить порядок их раздельного учета.
Налог на доходы физических лиц. Согласно ст. 226 и 230 НК РФ учет доходов, выплачиваемых физическим лицам, расчет налоговой базы и сумм НДФЛ, удержание и перечисление удержанного налога в бюджет должны осуществлять налоговые агенты. Ими признаются в числе прочих российские организации.
Если организация имеет обособленные подразделения, то она обязана перечислять суммы НДФЛ, подлежащие уплате в бюджет, по своему местонахождению и по местонахождению каждого обособленного подразделения – в отношении налогов, начисленных с доходов работников обособленных подразделений. Сумма НДФЛ, подлежащая уплате в бюджет по местонахождению обособленного подразделения, определяется согласно п. 7 ст. 226 НК РФ исходя из суммы дохода, подлежащего налогообложению, начисляемого и выплачиваемого работникам этих обособленных подразделений.
Обособленное подразделение само выплачивает вознаграждение по каждому работнику и ведет бухгалтерский учет их доходов, а также определяет налоговую базу по НДФЛ и его сумму. Тогда удержание НДФЛ из доходов своих работников и его перечисление также осуществляет обособленное подразделение. Головная организация должна официально передать эти полномочия обособленному подразделению.
Здесь необходимо отметить один существенный нюанс. Поскольку в налоговом законодательстве не определено понятие «работник обособленного подразделения», необходимое для определения суммы НДФЛ, подлежащей уплате в бюджет, налоговые органы при признании физического лица, заключившего трудовой договор с организацией, работником обособленного подразделения должны руководствоваться ст. 57 Трудового кодекса Российской Федерации (ТК РФ). Следовательно, если в трудовом договоре работодателем выступает головная организация, а в нем указано место работы – обособленное структурное подразделение, то налоговые органы вправе признать его работником этого подразделения. Если же местом работы в договоре указана головная организация, то работник будет признан работником головной организации, даже если он работает непосредственно в филиале. Но если при проверке налоговые органы обнаружат, что данный работник выполняет работу в обособленном подразделении, они могут признать его работником структурного подразделения. Практика показывает, что при определении налоговыми органами обязанностей обособленного подразделения по уплате сумм НДФЛ по своему местонахождению главным условием является факт выплаты дохода работнику обособленного подразделения организации.
