Французский флот был крайне слаб, британский же, пополнившись после Абукира захваченными французскими кораблями, властвовал над всем Средиземноморьем.
В октябре 1798 года на Мальте восстало местное население, англичане поддержали его огнем своих эскадр, и французский гарнизон был заперт в укреплениях Ла-Валлетты. Тогда же была отбита и Минорка. Адмирал Дункан совместно с русской Балтийской эскадрой вице-адмирала Макарова полностью контролировал Северное море. Эскадра лорда Бриджпорта сторожила французов у Бреста. Тяжело болевший граф Сент-Винсент большую часть времени находился в Гибралтаре. Отдельные эскадры адмиралов Кейта и Дукворта он держал попеременно у Кадиса и в порту Маон на Минорке, пресекая любые попытки французов предпринять какие-либо действия в Средиземном море.
Вести о победах Суворова вселили некоторую бодрость в сердце короля Фердинанда, который поверил, что ему не суждено будет до конца своих дней прозябать на Сицилии.
Едва российские полки нанесли французам первые поражения, как по всей Италии начали стихийно образовываться так называемые христианские отряды, которые возглавил уже знакомый нам кардинал Фабрицио Руффо.
Поддерживая повстанцев, Нельсон выслал отряд кораблей в Неаполитанский залив, были освобождены несколько прибрежных островов, а затем блокирован неапольский порт.
Наконец в мае Нельсон решает идти к Неаполю, не без оснований опасаясь, что русские могут его опередить. К плаванию срочно готовятся четырнадцать линейных кораблей и фрегаты, они должны были принять на борт 1600 человек королевской гвардии. Собралась «освобождать» Неаполь и чета Гамильтонов. Последнее не было одобрено ни королем, ни королевой. Однако, понимая всю пикантность ситуации, Мария Каролина все же решила отправить Гамильтонов в плавание. Своим приближенным она объяснила свое решение следующим образом:
— Пусть лорд Нельсон еще раз выкажет леди Гамильтон свою любовь и представит ее на короткое время королевой в Неаполе! Я не возражаю, лишь бы дело было сделано!
В назначенное время эскадра оставила Палермо и взяла курс на Неаполь. Но через два дня, ко всеобщему удивлению, снова вернулась в палермскую гавань. Оказалось, что в пути Нельсона встретили два линейных корабля с известием от главнокомандующего, что французский флот адмирала Брюи рискнул покинуть Тулон. Одновременно покинули Картахену и испанцы. Англичане сразу засуетились. К Тулону бросился адмирал Кейт, Нельсону было предписано спешить на перехват неприятеля и занять позицию у острова Маритимо, чтобы воспрепятствовать возможному соединению французского и испанского флотов. С большой неохотой Нельсон покинул Эмму. Под его командой было шестнадцать линейных кораблей.
