Хотя броня опускается ниже ватерлинии на 6,5 ф при обыкновенных условиях, но, так как от впуска воды в свое двойное дно при вступлении в бой, “Inflexible” углубится на 1 ф больше, как сказано выше, то для военного времени можно считать броневую его защиту на 7,5 ф ниже ватерлинии. Наружные плиты скреплены болтами, диаметром 4 дм, на которые с внутренней стороны навинчены гайки с эластической прокладкой. Шельф, на который положен нижний ряд плит, состоит из 1/2 дм стальных листов и углового железа.
На передней поперечной переборке, отделяющей каземат от носовых частей судна, расположение и толщина брони совершенно такие же, как и по борту каземата; на задней же переборке броня несколько тоньше: у ватерлинии 22 дм, выше ватерлинии 18 дм, и ниже ее-14 дм, а толщина тиковой подкладки 16, 20 и 24 дм, что составит общую толщину брони и подкладки на задней переборке каземата 38 дм. Здесь будет кстати упомянуть, что впереди и позади каземата шпангоуты корпуса состоят из углового железа 7x4 дм и покрыты снаружи листами в 9/16 дм. Броневое прикрытие для офицеров, управляющих судном, имеет крестообразную форму и защищено железными 12-дм плитами.
Расположение башен на “Inflexible” представляет одну из главных особенностей, отличающих его от остальных башенных судов английского флота. Обе башни расположены в стенах каземата не по диаметральной плоскости, а по сторонам ее на диагонали: передняя башня по левую сторону, а задняя по правую. Внутренний диаметр башен 28 ф, а наружный 33 ф 10 дм.
Башни эти первоначально предполагалось бронировать сплошными железными 18-дм плитами, которые считались тогда самыми толстыми, за исключением 22-дм пробных плит, прокатанных на завод г. Каммеля по заказу итальянского правительства для броненосцев “Duilio” и “Dandolo”. Но, благодаря техническому усовершенствованию бронепрокатного дела, вскоре явилась возможность заменить эти толстые железные плиты относительно более легкими, составными, сталежелезными, обладающими в то же время большей силой сопротивления ударам снарядов. Такими составными плитами было решено, в виде опыта, покрыть обе башни на “Inflexible”, и для этого первый или наружный ряд был положен из 9-дм сталежелезных плит, у которых верхний или стальной слой имеет толщину 3,5, дм, а второй или железный-5,5 дм. К этим плитам прилегает тиковая подкладка, толщиною 8 дм, а затем положен второй внутренний ряд железных плит в 7 дм, которые скреплены изнутри с наружными плитами стальными болтами. Высота нижних косяков башенных амбразур от грузовой ватерлинии 12 ф.
