Назначенный «директором наук» и инспектором Замойской академии, он стал приглашать туда знаменитых профессоров-гуманистов, озаботился созданием библиотеки и «русской типографии» для издания книг на славянских языках. Но денег, выделенных покровителем, не хватало, знаменитости из Италии не приехали. Удалось привлечь только нескольких молодых магистров из Кракова да горстку иностранцев — английского правоведа Уильяма Брюса, итальянского теолога Доменико Конвалиса, голландского математика Адриана ван Ромена. Ливонский дипломат, просветитель и первопечатник Давид Хильхен, сосланный в конце жизни из Риги в Замостье, успел собрать прекрасную коллекцию древних рукописей и наладил работу типографии.
Изначально академия состояла из трех факультетов: вольных искусств, права и медицины. С 1637 года она получила право присваивать степень доктора философии, а в 1648-м возник теологический факультет. В 1669 году учебное заведение получило статус университета, став первым частным учебным заведением такого ранга. Правда, студентов там было сравнительно немного: в 1595-м — порядка семидесяти, а в 1646-м — около 120. Наследники Замойского вели многолетнюю упорную борьбу с епископом Хелмно за право контролировать университет; неудивительно, что Замойская академия быстро скатилась до уровня двух других польских университетов, которые готовили юрисконсультов для судебной системы и кандидатов на церковные должности. Попытки реформировать образовательный процесс результатов не дали, университет захирел и в 1784 году был закрыт австрийцами и превращен в среднюю школу.
И всё же дело Замойской академии не осталось втуне. Киевский православный митрополит Петр Могила считал, что она «много пользы и утешения принесла». Сам он вошел в историю благодаря созданной им Киево-Могилянской академии, пройдя тем же путем, что и его европейские предшественники 500 лет назад.
Ее предшественницей была Киевская братская школа: 15 октября 1615 года при типографии Киево-Печерского монастыря в поселке Новый Свет был создан кружок Киевского Богоявленского братства под покровительством архимандрита Елисея Плетенецкого. За основу ее устава, принятого в 1620 году, был взят устав Львовской братской школы, к тому же в Киеве преподавали некоторые учителя из Львова и Луцка.
В 1631 году митрополит Киевский и Галичский, архимандрит Киево-Печерской лавры Петр Могила основал Лаврскую школу, которая годом позже присоединилась к школе братства. Материальную поддержку школе оказывали запорожцы, в частности гетман Петр Сагайдачный, ведь учились там в основном дети мещан и казаков. Петр Могила европеизировал это учебное заведение, переориентировав его на «латинскую» систему.
